17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2183 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2183  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713238  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1848  hypothetical protein  99.31 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.831934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1799  hypothetical protein  97.92 
 
 		 144 aa  260  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2719  hypothetical protein  87.29 
 
 		 144 aa  221  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198095  normal  0.18171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5315  hypothetical protein  60.98 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5011  hypothetical protein  60 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334367  normal  0.114174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  44.17 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2610  hypothetical protein  41.1 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2584  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1242  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.114711  normal  0.983634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1939  hypothetical protein  35.9 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0485  hypothetical protein  37.23 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0028  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3936  hypothetical protein  40.54 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2666  hypothetical protein  45.07 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0587658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  27.78 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  31.15 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>