15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0028 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0028  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2584  hypothetical protein  73.77 
 
 		 147 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1242  hypothetical protein  73.77 
 
 		 147 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.114711  normal  0.983634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1939  hypothetical protein  74.59 
 
 		 147 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0485  hypothetical protein  58.2 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3936  hypothetical protein  54.1 
 
 		 147 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2666  hypothetical protein  54.1 
 
 		 148 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0587658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2610  hypothetical protein  40.86 
 
 		 142 aa  88.2  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2719  hypothetical protein  40.21 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198095  normal  0.18171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5011  hypothetical protein  33.94 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334367  normal  0.114174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5315  hypothetical protein  30.33 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1848  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.831934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2183  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713238  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1799  hypothetical protein  41.67 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  30.43 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>