More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  41.19 
 
 		 1143 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 1200 aa  2441    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  42.71 
 
 		 1135 aa  658    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  53.59 
 
 		 1505 aa  1025    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  48.12 
 
 		 1444 aa  942    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.68 
 
 		 945 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  41.42 
 
 		 1142 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 1151 aa  608  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  40.66 
 
 		 1182 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  39.29 
 
 		 1138 aa  599  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.39 
 
 		 953 aa  588  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  45.79 
 
 		 941 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  45.26 
 
 		 918 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 800 aa  466  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  42.34 
 
 		 909 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  41.34 
 
 		 908 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  34.48 
 
 		 1194 aa  412  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  38.89 
 
 		 984 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  38.08 
 
 		 918 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.77 
 
 		 1029 aa  230  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  43.04 
 
 		 392 aa  193  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 232 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 272 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  38.1 
 
 		 279 aa  162  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  39.09 
 
 		 247 aa  160  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 245 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  34.39 
 
 		 260 aa  154  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  39.39 
 
 		 255 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  29.62 
 
 		 999 aa  152  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  29.62 
 
 		 999 aa  152  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  29.46 
 
 		 999 aa  151  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  38.21 
 
 		 895 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  33.76 
 
 		 275 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.97 
 
 		 1657 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  25.34 
 
 		 1081 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  26.78 
 
 		 712 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  26.53 
 
 		 841 aa  138  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  36.4 
 
 		 375 aa  135  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  37.05 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.81 
 
 		 892 aa  129  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 277 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  31.51 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  25.35 
 
 		 1132 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.2 
 
 		 585 aa  115  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  31.23 
 
 		 266 aa  115  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  25.04 
 
 		 972 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  29.87 
 
 		 342 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  30.13 
 
 		 285 aa  108  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.81 
 
 		 442 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.86 
 
 		 414 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  30.66 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  35.21 
 
 		 422 aa  100  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.14 
 
 		 387 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  28.74 
 
 		 408 aa  98.2  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  34.71 
 
 		 371 aa  97.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  31.07 
 
 		 385 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  27.3 
 
 		 2172 aa  96.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  30.47 
 
 		 385 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.38 
 
 		 396 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.72 
 
 		 450 aa  93.2  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.24 
 
 		 369 aa  92.8  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  28.84 
 
 		 363 aa  92.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  28.24 
 
 		 394 aa  92  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  27.2 
 
 		 346 aa  91.7  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.82 
 
 		 385 aa  91.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.77 
 
 		 520 aa  90.9  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.18 
 
 		 809 aa  91.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  26.91 
 
 		 382 aa  90.1  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  27.54 
 
 		 255 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  27.07 
 
 		 387 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  28.21 
 
 		 292 aa  89.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.64 
 
 		 455 aa  89.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.17 
 
 		 367 aa  89.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  26.64 
 
 		 387 aa  89.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.1 
 
 		 360 aa  89  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  26.84 
 
 		 387 aa  89  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 		 388 aa  89  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 367 aa  88.6  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 391 aa  88.2  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  28.36 
 
 		 369 aa  87.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 399 aa  87  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  27.93 
 
 		 410 aa  87  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 395 aa  87  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.37 
 
 		 729 aa  86.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.62 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  25.58 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.73 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  25.5 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.72 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  26.13 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 403 aa  84.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.83 
 
 		 374 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  23.44 
 
 		 430 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  28.83 
 
 		 374 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  25.77 
 
 		 428 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  30.42 
 
 		 263 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 530 aa  84  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  28.04 
 
 		 306 aa  84  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  32.89 
 
 		 400 aa  83.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  27.95 
 
 		 377 aa  83.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>