263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0391 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
455 aa  922    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  75.05 
 
 
451 aa  679    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.02 
 
 
450 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  54 
 
 
367 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.46 
 
 
427 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.85 
 
 
388 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  50.57 
 
 
371 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.56 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.55 
 
 
387 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  41.88 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.67 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.68 
 
 
392 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.14 
 
 
403 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.36 
 
 
396 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  38.65 
 
 
475 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  45.83 
 
 
461 aa  260  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.1 
 
 
460 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.44 
 
 
570 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.42 
 
 
442 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  36.46 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  42.51 
 
 
400 aa  212  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  38.8 
 
 
419 aa  210  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  36.41 
 
 
676 aa  206  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.62 
 
 
520 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  37.08 
 
 
469 aa  192  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  34.14 
 
 
471 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  34.04 
 
 
766 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  33.18 
 
 
875 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  40.4 
 
 
488 aa  173  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  38.28 
 
 
748 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  31.79 
 
 
2172 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.1 
 
 
1657 aa  146  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  34.4 
 
 
342 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  35.82 
 
 
585 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  34.74 
 
 
1029 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  32.63 
 
 
712 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  30.9 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  33.75 
 
 
841 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  27.91 
 
 
561 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30.27 
 
 
972 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 
367 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.68 
 
 
1132 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  31.14 
 
 
363 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 
370 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  32.67 
 
 
385 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  32.67 
 
 
385 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  32.69 
 
 
385 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  27.87 
 
 
374 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  27.87 
 
 
374 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  35.71 
 
 
388 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.7 
 
 
408 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  32.03 
 
 
263 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  26.32 
 
 
418 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  26.56 
 
 
1151 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  28.79 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.52 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  27.83 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  27.68 
 
 
411 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  26.03 
 
 
369 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  25.45 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.93 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  30.24 
 
 
377 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  28.45 
 
 
410 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.01 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  40.94 
 
 
192 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  24.85 
 
 
395 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  32.65 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  25.53 
 
 
462 aa  93.2  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 
386 aa  93.2  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  29.61 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  27.15 
 
 
432 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 
1200 aa  89.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  28.96 
 
 
999 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  28.96 
 
 
999 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.3 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.82 
 
 
366 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  27.04 
 
 
918 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  32.92 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  30.33 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25.62 
 
 
430 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  25.77 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  25.76 
 
 
476 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  27.71 
 
 
379 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  34.83 
 
 
374 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  27.98 
 
 
377 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  28.13 
 
 
999 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  25.63 
 
 
428 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  25.76 
 
 
476 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  26.75 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  35.91 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2738  hypothetical protein  25.94 
 
 
476 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  31.03 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  26.17 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  28.8 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  27.64 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2709  hypothetical protein  25.92 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  25.94 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>