275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0485 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 387 aa  793    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  60.33 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.7 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  49.87 
 
 		 371 aa  338  8e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  43.49 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.89 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.8 
 
 		 388 aa  288  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.93 
 
 		 455 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 		 451 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.03 
 
 		 427 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.95 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.87 
 
 		 450 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  43.7 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  38.9 
 
 		 482 aa  226  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  40.16 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.04 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.27 
 
 		 403 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  34.58 
 
 		 471 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  39.45 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  38.19 
 
 		 676 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.27 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.21 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.13 
 
 		 442 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  34.63 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  35.28 
 
 		 875 aa  182  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  34.29 
 
 		 2172 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.94 
 
 		 520 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  34.02 
 
 		 475 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 766 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  38.67 
 
 		 488 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  30.73 
 
 		 748 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  35.47 
 
 		 518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  28.78 
 
 		 712 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  34.71 
 
 		 841 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.71 
 
 		 585 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.66 
 
 		 1657 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  30.66 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.84 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.45 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  34.84 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  24.8 
 
 		 530 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  27.09 
 
 		 972 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.56 
 
 		 561 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  27.6 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  26.85 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  26.55 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.86 
 
 		 1029 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  27.23 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  28.27 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  26.54 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  24.74 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.25 
 
 		 729 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.98 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.69 
 
 		 892 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  31.68 
 
 		 908 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  25.73 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  28.45 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  31.08 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.14 
 
 		 1200 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  29.46 
 
 		 918 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  28.48 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  32.22 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  26.96 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  32.74 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  30.26 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  34.67 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 462 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  25.78 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  28.2 
 
 		 999 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  28.2 
 
 		 999 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  26.08 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  27.94 
 
 		 999 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  26.27 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  36.36 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  26.11 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  32.65 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  32.1 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  26.02 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2451  glucose sorbosone dehydrogenase  26.92 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  25.36 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.38 
 
 		 809 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  26.32 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  26.67 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  25.73 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  30.16 
 
 		 381 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  28.79 
 
 		 1182 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  31.62 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  26.77 
 
 		 372 aa  93.2  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  33.86 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  28.12 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  27.88 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  25.43 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>