252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0140 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  939    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  47.99 
 
 		 766 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  40.47 
 
 		 471 aa  302  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  45.98 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  38.6 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  44.53 
 
 		 748 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  37.69 
 
 		 676 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.97 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  38.28 
 
 		 875 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  35.53 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.32 
 
 		 455 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  36.19 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.5 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.73 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.32 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.88 
 
 		 387 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.19 
 
 		 427 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.17 
 
 		 388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.13 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.76 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.17 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.28 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.1 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  35.43 
 
 		 585 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  33.08 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.18 
 
 		 442 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  32.26 
 
 		 518 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  35.71 
 
 		 342 aa  146  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  34.18 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  28.51 
 
 		 475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.56 
 
 		 2172 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.31 
 
 		 488 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.32 
 
 		 570 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.84 
 
 		 841 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  30.55 
 
 		 712 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  27.41 
 
 		 561 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.3 
 
 		 520 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.86 
 
 		 1029 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.31 
 
 		 1657 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  32.97 
 
 		 999 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  32.04 
 
 		 999 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  32.04 
 
 		 999 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  30.24 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  28.01 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  29.12 
 
 		 392 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  27.05 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.07 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  32.82 
 
 		 367 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.79 
 
 		 382 aa  90.5  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  31.43 
 
 		 381 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  28.89 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  28.36 
 
 		 381 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  28.52 
 
 		 908 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.92 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  30.45 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  26.62 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  27.44 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  25.77 
 
 		 1132 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  27.99 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.13 
 
 		 1200 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.66 
 
 		 1505 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  26.05 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  27.91 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.25 
 
 		 729 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.07 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  27.92 
 
 		 392 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2451  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  24.85 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  25.17 
 
 		 1182 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.48 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  25.42 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.16 
 
 		 945 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  26.61 
 
 		 1138 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  26.27 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  29.1 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  27.08 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  28.16 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  27.72 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  35.4 
 
 		 192 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  26.43 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  27.92 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  26.33 
 
 		 941 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  25.97 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  27.92 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  27.42 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  28.2 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  29.27 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  26.86 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  27.92 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  26.73 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  27.92 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  27.92 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  26.87 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  28.78 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.2 
 
 		 892 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>