235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1937 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 263 aa  550  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  61.45 
 
 		 1132 aa  337  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  46.74 
 
 		 972 aa  215  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  38.17 
 
 		 1657 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.25 
 
 		 585 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.25 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  34.93 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.63 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.24 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.13 
 
 		 570 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  33.2 
 
 		 461 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  35.32 
 
 		 1029 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.03 
 
 		 455 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.89 
 
 		 367 aa  98.6  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.68 
 
 		 460 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.45 
 
 		 841 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  32.84 
 
 		 371 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.22 
 
 		 387 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.78 
 
 		 388 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  28.98 
 
 		 712 aa  95.5  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  28.81 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.35 
 
 		 450 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  29.34 
 
 		 371 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  29.46 
 
 		 371 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  29.34 
 
 		 371 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  29.34 
 
 		 371 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  29.46 
 
 		 371 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  29.46 
 
 		 371 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  29.85 
 
 		 1182 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 392 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  28.96 
 
 		 371 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.96 
 
 		 371 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.87 
 
 		 414 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  33.2 
 
 		 363 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.6 
 
 		 403 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.6 
 
 		 388 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  32.91 
 
 		 422 aa  89  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.76 
 
 		 451 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 		 388 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  27.8 
 
 		 391 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.91 
 
 		 442 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  34.21 
 
 		 999 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  34.21 
 
 		 999 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 360 aa  85.5  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.6 
 
 		 360 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  34.39 
 
 		 999 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  31.51 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  32.08 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  29 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.91 
 
 		 892 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  31.67 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  30.37 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.42 
 
 		 1200 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  25.61 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  28.51 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  29.41 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  29.41 
 
 		 909 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.27 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  30.48 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  27.67 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  26.89 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 418 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  28.63 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  29.8 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  30.05 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  27.71 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  26.11 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  29.1 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  34.76 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  28.17 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  28.63 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  29.11 
 
 		 530 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  28.52 
 
 		 471 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.19 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  30.22 
 
 		 381 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.72 
 
 		 408 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  28.63 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  29.68 
 
 		 387 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  25.57 
 
 		 918 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  27.01 
 
 		 918 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  34.18 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  26.36 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  32.68 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  26.52 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  27.48 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.57 
 
 		 520 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  30.18 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  29.78 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28.19 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  27.85 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 482 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  31.16 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>