More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0779 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 999 aa  2010    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 999 aa  2010    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  98.3 
 
 		 999 aa  1979    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  45.45 
 
 		 1029 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  48.7 
 
 		 585 aa  277  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  46.61 
 
 		 342 aa  275  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  31.14 
 
 		 1657 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  33.14 
 
 		 841 aa  234  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  29.32 
 
 		 712 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  30.12 
 
 		 1132 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32.1 
 
 		 972 aa  200  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.72 
 
 		 892 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 1200 aa  156  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  30.65 
 
 		 1081 aa  148  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.7 
 
 		 729 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.39 
 
 		 450 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.12 
 
 		 414 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.21 
 
 		 396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.65 
 
 		 945 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  30.13 
 
 		 363 aa  126  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  26.03 
 
 		 1138 aa  125  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  25.81 
 
 		 1143 aa  121  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  25.64 
 
 		 941 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  25.85 
 
 		 918 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  24.49 
 
 		 918 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.91 
 
 		 1444 aa  114  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  25.27 
 
 		 1142 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  26.12 
 
 		 1135 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  35.34 
 
 		 461 aa  114  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  25.22 
 
 		 1182 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  25.75 
 
 		 909 aa  111  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  25.32 
 
 		 391 aa  111  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  31.9 
 
 		 371 aa  110  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.62 
 
 		 809 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  29.49 
 
 		 382 aa  110  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  29.11 
 
 		 378 aa  109  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  24.04 
 
 		 984 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  33.47 
 
 		 398 aa  108  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  28.18 
 
 		 377 aa  108  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  30.91 
 
 		 766 aa  108  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.23 
 
 		 1505 aa  107  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 		 381 aa  107  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 		 422 aa  107  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  26.47 
 
 		 395 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  28.53 
 
 		 383 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 		 367 aa  106  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  31.43 
 
 		 410 aa  106  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  32.6 
 
 		 369 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 466 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.85 
 
 		 953 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  24.16 
 
 		 1151 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.47 
 
 		 367 aa  104  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  27.61 
 
 		 365 aa  104  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 		 388 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  30.34 
 
 		 676 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  33.74 
 
 		 343 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  33.21 
 
 		 402 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  37.3 
 
 		 405 aa  102  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  30.89 
 
 		 394 aa  102  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  28.09 
 
 		 387 aa  102  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  25.33 
 
 		 908 aa  101  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  31.69 
 
 		 482 aa  101  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  27.55 
 
 		 387 aa  101  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.37 
 
 		 442 aa  101  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.89 
 
 		 360 aa  100  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.66 
 
 		 427 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  27.94 
 
 		 408 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  32.76 
 
 		 357 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.52 
 
 		 387 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  32.39 
 
 		 400 aa  100  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.25 
 
 		 460 aa  99.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  29.91 
 
 		 381 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 		 407 aa  99  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  26.97 
 
 		 381 aa  99  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  27.64 
 
 		 392 aa  99  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.72 
 
 		 360 aa  98.6  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  28.88 
 
 		 372 aa  98.6  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  30.89 
 
 		 366 aa  98.6  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.19 
 
 		 392 aa  99  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.99 
 
 		 570 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  32.26 
 
 		 388 aa  98.2  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  26.42 
 
 		 410 aa  98.2  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  27.19 
 
 		 374 aa  97.8  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  28.73 
 
 		 469 aa  97.8  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 		 381 aa  97.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  32.09 
 
 		 382 aa  97.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  26.77 
 
 		 471 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  29.18 
 
 		 375 aa  97.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  34.21 
 
 		 263 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  27.71 
 
 		 377 aa  96.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 388 aa  97.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  37.7 
 
 		 374 aa  96.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  27.57 
 
 		 373 aa  95.9  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  26.43 
 
 		 382 aa  95.9  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  29.08 
 
 		 376 aa  96.3  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 		 530 aa  96.3  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 		 378 aa  95.1  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  26.56 
 
 		 387 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.15 
 
 		 394 aa  94  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.74 
 
 		 369 aa  94  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>