293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1010 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  100 
 
 
342 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  80.24 
 
 
585 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  46.24 
 
 
1029 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  46.61 
 
 
999 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  46.61 
 
 
999 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  46.33 
 
 
999 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  38.71 
 
 
1657 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 
367 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  37.19 
 
 
371 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.87 
 
 
367 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  35.56 
 
 
388 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.71 
 
 
450 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  34.5 
 
 
366 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.04 
 
 
396 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  35.76 
 
 
461 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  34.75 
 
 
422 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  35.71 
 
 
469 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.4 
 
 
455 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  31.68 
 
 
410 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  37.07 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.68 
 
 
442 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.04 
 
 
451 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.71 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.24 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.46 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.1 
 
 
809 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  31.4 
 
 
382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30 
 
 
394 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  31.45 
 
 
408 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  39.92 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.92 
 
 
729 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  33.54 
 
 
399 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  30.26 
 
 
712 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  31.76 
 
 
376 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  35.5 
 
 
369 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  35.68 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  31.75 
 
 
419 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  31.63 
 
 
377 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  31.3 
 
 
383 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  33.22 
 
 
394 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  30.97 
 
 
388 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.87 
 
 
365 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  29.78 
 
 
388 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  30.7 
 
 
369 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  32.18 
 
 
465 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  31.72 
 
 
388 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  30.94 
 
 
418 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  29.26 
 
 
430 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.1 
 
 
403 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 
428 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.07 
 
 
427 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.66 
 
 
387 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  32.48 
 
 
399 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.41 
 
 
391 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.94 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  31.01 
 
 
395 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  31.78 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  31.76 
 
 
1132 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 
972 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
385 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  37.74 
 
 
343 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  29.23 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  30.2 
 
 
462 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  33.13 
 
 
405 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 
432 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  32.91 
 
 
401 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.93 
 
 
460 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  36.12 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  29.68 
 
 
381 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  32.09 
 
 
366 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  34.19 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.44 
 
 
407 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 
386 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  30.13 
 
 
530 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  32.96 
 
 
385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  30.29 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  27.27 
 
 
1138 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.36 
 
 
388 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.24 
 
 
378 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  33.11 
 
 
335 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 
396 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.1 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  31.1 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  31.09 
 
 
377 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  30.64 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  32.37 
 
 
676 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
800 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  34.19 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  30.39 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  30.09 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  32.72 
 
 
374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.97 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  33.21 
 
 
385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  31.3 
 
 
391 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>