262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0140 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  74.4 
 
 		 455 aa  675    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 451 aa  906    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.56 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.05 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.99 
 
 		 367 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.24 
 
 		 388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  51.16 
 
 		 371 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.24 
 
 		 388 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.53 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.2 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  45.13 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.31 
 
 		 392 aa  262  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.37 
 
 		 403 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  39.8 
 
 		 475 aa  257  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  45.53 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.04 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.87 
 
 		 570 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.87 
 
 		 442 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  43.05 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  34.69 
 
 		 482 aa  209  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  39.89 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  36.65 
 
 		 676 aa  204  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  35.47 
 
 		 766 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  34.48 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.12 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  37.15 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  34.83 
 
 		 875 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  31.33 
 
 		 2172 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  38.42 
 
 		 488 aa  156  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  39.1 
 
 		 748 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.33 
 
 		 1657 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  34.04 
 
 		 342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32.77 
 
 		 1029 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  34.75 
 
 		 585 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  31.99 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  34.49 
 
 		 712 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  27.2 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.54 
 
 		 841 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  33.61 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  31.74 
 
 		 972 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  32.91 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  32.59 
 
 		 385 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  28.15 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.91 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  37.44 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  31.37 
 
 		 385 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  28.18 
 
 		 391 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  34.33 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  27.68 
 
 		 1132 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  27.36 
 
 		 390 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  27.22 
 
 		 399 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  27.72 
 
 		 374 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  27.72 
 
 		 374 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  28.87 
 
 		 1151 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  26.86 
 
 		 376 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  26.82 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  26.7 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  29.08 
 
 		 462 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  25.06 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  27.79 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  30.96 
 
 		 394 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.21 
 
 		 394 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.21 
 
 		 369 aa  91.3  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  25.34 
 
 		 395 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  26.24 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 		 366 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  32.77 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  25.48 
 
 		 392 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  27.58 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  37.08 
 
 		 399 aa  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  27.93 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  26.39 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  27.76 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  24.66 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  28.33 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  31.56 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  37.36 
 
 		 374 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  27.65 
 
 		 918 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  31.12 
 
 		 263 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  25.76 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  30.56 
 
 		 908 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  32.63 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  25.89 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  28.71 
 
 		 999 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  28.71 
 
 		 999 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.72 
 
 		 1200 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  27.02 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  26.19 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  31.86 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.18 
 
 		 729 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  25.3 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  25.8 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  27.85 
 
 		 999 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  26.35 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  25 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>