More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0504 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 367 aa  716    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  49.85 
 
 		 394 aa  322  5e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  49.23 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  47.16 
 
 		 410 aa  289  4e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  43.64 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  45.7 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  42.17 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  41.23 
 
 		 360 aa  238  9e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  45.87 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  45.35 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  43.52 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  45.43 
 
 		 369 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  43.22 
 
 		 385 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  39.94 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  42.94 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  42.37 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  41.34 
 
 		 406 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  41.04 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  41.96 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  41.62 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.97 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  43.56 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  44.98 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.18 
 
 		 809 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  41.74 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  43.83 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  41.21 
 
 		 374 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  36.12 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  42.86 
 
 		 388 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  37.05 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.08 
 
 		 365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  40.82 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  37.28 
 
 		 353 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  34.92 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  37.78 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  37.93 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  35.36 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  38.97 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  36.46 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  35.5 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  35.86 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  38.42 
 
 		 404 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 		 375 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  37.65 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  36.56 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  36.02 
 
 		 357 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.91 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  36.08 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  37.4 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  39.94 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  37.39 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 		 383 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  39.65 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  38.02 
 
 		 442 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  36.71 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  37.07 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  36.32 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  33.79 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  36.2 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  37.23 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  37.37 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  37.4 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.88 
 
 		 729 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  35.92 
 
 		 530 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  36.09 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.34 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  35.75 
 
 		 367 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  36.36 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.42 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  35.77 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  37.75 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  36.55 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.36 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  35.48 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  34.3 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  34.3 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  35.19 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  34.3 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  37.18 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  35.23 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  34.32 
 
 		 370 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  34.3 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  34.01 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  36.99 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  35.21 
 
 		 377 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  31.38 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  34.77 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  35.17 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  34.7 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  35.2 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.55 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  36.13 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.82 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  35.5 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  39.13 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.45 
 
 		 585 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>