294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0845 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
401 aa  762    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  53.87 
 
 
407 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  52.56 
 
 
404 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  52.36 
 
 
442 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  53.57 
 
 
360 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  53.89 
 
 
399 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  46.29 
 
 
374 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  46.88 
 
 
398 aa  292  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  47.38 
 
 
369 aa  292  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  47.73 
 
 
406 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  48.56 
 
 
369 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  46.67 
 
 
389 aa  288  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  51.93 
 
 
381 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  46.8 
 
 
394 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  49.1 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  43.7 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  43.16 
 
 
335 aa  256  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  45.7 
 
 
343 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  44.16 
 
 
388 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  44.08 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.14 
 
 
809 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  37.87 
 
 
381 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  41.1 
 
 
377 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  41.04 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  35.38 
 
 
394 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.7 
 
 
369 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  41.07 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.83 
 
 
729 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.09 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  36.43 
 
 
408 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  38.93 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  40.66 
 
 
385 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 
363 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  40.38 
 
 
385 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  37.88 
 
 
443 aa  169  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  38.16 
 
 
469 aa  169  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  33.89 
 
 
410 aa  163  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  37.77 
 
 
387 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  37.55 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  30.13 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.92 
 
 
365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  33.97 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  32.61 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  30.7 
 
 
391 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 
430 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.54 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  33.71 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  35.22 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  33.49 
 
 
405 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  32.67 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  31.59 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  34.57 
 
 
392 aa  129  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  33.72 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  32.16 
 
 
530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  34.92 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  32.97 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  32.21 
 
 
381 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 
400 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.38 
 
 
384 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  31.18 
 
 
406 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  35.25 
 
 
391 aa  126  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  28.89 
 
 
387 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 
399 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  29.6 
 
 
387 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  31.67 
 
 
381 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  31.93 
 
 
381 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 
395 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  31.92 
 
 
418 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  32.97 
 
 
366 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.1 
 
 
400 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.6 
 
 
376 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  26.98 
 
 
392 aa  123  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  31.55 
 
 
380 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  30.31 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  36.69 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  31.62 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  29.32 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  30.45 
 
 
383 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  34.37 
 
 
432 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  30.81 
 
 
368 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.58 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  32.23 
 
 
391 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  27.81 
 
 
388 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  29.66 
 
 
466 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  31.88 
 
 
388 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  33.89 
 
 
428 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  29.78 
 
 
382 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  29.63 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  27.81 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>