279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4646 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 405 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  52.68 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  54.49 
 
 		 381 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  50.43 
 
 		 374 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  46 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  52.82 
 
 		 388 aa  307  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  50 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  50.14 
 
 		 369 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  50.14 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  51.6 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  48.8 
 
 		 335 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.11 
 
 		 809 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  45.41 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  44.11 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  45.24 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.44 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  46.09 
 
 		 401 aa  266  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  48.78 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  45.67 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  40 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  43.57 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  43.38 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  38.58 
 
 		 357 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  43.52 
 
 		 367 aa  229  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 		 369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  37.22 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.71 
 
 		 729 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  33.49 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  39.11 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  38.83 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  38.72 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  37.6 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  35.89 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  33.65 
 
 		 407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  37.5 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  32.88 
 
 		 443 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.49 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  35.9 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  33.1 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  32.27 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  33.1 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.17 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.07 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  33.74 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  34.43 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  35.34 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  30.64 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  35.75 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  35.32 
 
 		 374 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  34.84 
 
 		 392 aa  150  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  32.88 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  32.25 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  30.89 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  32.25 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  30.34 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  34.19 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  33.87 
 
 		 465 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  34.71 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  33.42 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  32.14 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  34.22 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.03 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  31.54 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  34.04 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  34.67 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  32.87 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.47 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.17 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  32.43 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  33.9 
 
 		 376 aa  143  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  32.01 
 
 		 392 aa  143  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  33.6 
 
 		 370 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  32.34 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.91 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  32.51 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  30.35 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.17 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  31.02 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  34 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  31.35 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  29.56 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.61 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  33.16 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>