212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0663 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 367 aa  722    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  50.26 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4543  glucose sorbosone dehydrogenase  41.58 
 
 		 412 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2041  glucose sorbosone dehydrogenase  39.59 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  37.57 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  37.54 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1990  hypothetical protein  33.57 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  34.19 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  32.98 
 
 		 413 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  36.56 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  34.07 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.63 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  35.7 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  34.78 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  34.65 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  32.25 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  31.87 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  31.41 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.85 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  32.85 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  36.09 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  32.29 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  32.28 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  35.22 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  36.56 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  34.25 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.65 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  30.22 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  30.45 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  30.39 
 
 		 387 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  32.83 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  29.55 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  34.83 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  32.29 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  29.51 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  34.54 
 
 		 404 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  30.08 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  30.46 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  36.84 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28.83 
 
 		 382 aa  120  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  29.08 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.44 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  33.63 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  31.22 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.2 
 
 		 809 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  30.51 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.64 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  32.28 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  29.53 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  31.42 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.47 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  30.21 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  27.76 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  30.81 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  31.16 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  30.28 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  32.3 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  31.16 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  29.67 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.23 
 
 		 387 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.96 
 
 		 407 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  29.62 
 
 		 392 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  31.55 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  31 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  32.46 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2451  glucose sorbosone dehydrogenase  31.22 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  30.81 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  31.05 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  32.38 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  27.96 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  30.33 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  31.03 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  30.59 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  32.47 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  29.53 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  27.72 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  29.49 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  30.95 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  32.17 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  27.88 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  30.75 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  27.86 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  31.46 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  30.21 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  30.24 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  30.39 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  31.3 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  29.8 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 399 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>