More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5117 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1132 aa  2326    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  44.26 
 
 		 972 aa  621  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.85 
 
 		 1657 aa  340  7e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  61.45 
 
 		 263 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.35 
 
 		 1029 aa  234  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  31.76 
 
 		 1391 aa  194  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  29.91 
 
 		 999 aa  192  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  29.91 
 
 		 999 aa  192  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  29.67 
 
 		 999 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  51.19 
 
 		 801 aa  178  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  40.61 
 
 		 884 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  28.62 
 
 		 841 aa  151  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  32.82 
 
 		 1295 aa  147  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  29.31 
 
 		 1338 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.39 
 
 		 892 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 		 541 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  33.66 
 
 		 536 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  28.65 
 
 		 930 aa  141  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  47.2 
 
 		 1799 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  28.5 
 
 		 712 aa  140  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  39.73 
 
 		 957 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1167 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  53.6 
 
 		 639 aa  135  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  33.45 
 
 		 550 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  50.79 
 
 		 610 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  52.5 
 
 		 673 aa  132  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  32.73 
 
 		 524 aa  131  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  48.15 
 
 		 982 aa  131  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  37.85 
 
 		 726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.05 
 
 		 427 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 		 526 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.77 
 
 		 585 aa  125  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  40.14 
 
 		 798 aa  125  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  27.34 
 
 		 1234 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  31.76 
 
 		 342 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  40.94 
 
 		 1035 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  37 
 
 		 630 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.08 
 
 		 933 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  48.74 
 
 		 389 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  24.69 
 
 		 918 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  47.46 
 
 		 869 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  41.89 
 
 		 1356 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  45.24 
 
 		 705 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.35 
 
 		 1200 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.54 
 
 		 396 aa  115  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  38.95 
 
 		 627 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.97 
 
 		 388 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  42.28 
 
 		 863 aa  114  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  48.78 
 
 		 853 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  42 
 
 		 823 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  29.43 
 
 		 419 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  49.15 
 
 		 383 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  41.22 
 
 		 845 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  41.89 
 
 		 802 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 		 870 aa  111  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  37.75 
 
 		 855 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  41.78 
 
 		 966 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  37.97 
 
 		 918 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  38.99 
 
 		 500 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 1262 aa  109  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  36.87 
 
 		 948 aa  109  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.22 
 
 		 392 aa  108  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.16 
 
 		 570 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.88 
 
 		 503 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.99 
 
 		 450 aa  107  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.31 
 
 		 1321 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  39.73 
 
 		 1380 aa  107  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  38.41 
 
 		 1091 aa  106  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  24.09 
 
 		 1135 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  38.32 
 
 		 1004 aa  106  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.68 
 
 		 455 aa  105  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  30.53 
 
 		 461 aa  105  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  44 
 
 		 840 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  33.86 
 
 		 468 aa  105  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  39.58 
 
 		 735 aa  104  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  24.52 
 
 		 1138 aa  104  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.27 
 
 		 367 aa  104  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  55.88 
 
 		 1152 aa  104  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  23.1 
 
 		 1182 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  40.56 
 
 		 581 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 		 719 aa  103  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  46.9 
 
 		 461 aa  101  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  39.04 
 
 		 1732 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  38.51 
 
 		 777 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  31.22 
 
 		 1444 aa  100  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.16 
 
 		 1505 aa  100  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.25 
 
 		 786 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.92 
 
 		 403 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  36.31 
 
 		 739 aa  99.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  43.48 
 
 		 877 aa  99  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  24.03 
 
 		 909 aa  99  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.41 
 
 		 414 aa  98.2  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  24.27 
 
 		 918 aa  98.2  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  23.79 
 
 		 984 aa  98.2  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.68 
 
 		 451 aa  98.2  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.36 
 
 		 3295 aa  97.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.72 
 
 		 442 aa  97.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.84 
 
 		 388 aa  97.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.55 
 
 		 2554 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  26.47 
 
 		 372 aa  96.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>