249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1130 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  795    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  51.85 
 
 
482 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  49.89 
 
 
676 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  43.8 
 
 
471 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  45.35 
 
 
875 aa  333  4e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  44.59 
 
 
766 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  46.73 
 
 
469 aa  286  4e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  39.13 
 
 
422 aa  239  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.68 
 
 
450 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  41.98 
 
 
748 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  40.48 
 
 
371 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.45 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.25 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.78 
 
 
451 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.71 
 
 
427 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.52 
 
 
367 aa  203  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.05 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.24 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.86 
 
 
460 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.6 
 
 
388 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  40.12 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.28 
 
 
388 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.69 
 
 
403 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.83 
 
 
392 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.1 
 
 
442 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  31.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  32.61 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  31.01 
 
 
2172 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.63 
 
 
561 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.11 
 
 
520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  33.03 
 
 
712 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  33.84 
 
 
518 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  38.82 
 
 
1029 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.98 
 
 
570 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  37.97 
 
 
585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  34.19 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  35.51 
 
 
1657 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  25.21 
 
 
476 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  29.79 
 
 
841 aa  99.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  24.95 
 
 
476 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  25.53 
 
 
476 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.52 
 
 
488 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2738  hypothetical protein  25.42 
 
 
476 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.42 
 
 
369 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2774  hypothetical protein  25.42 
 
 
476 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.42 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2581  hypothetical protein  25.21 
 
 
476 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2524  hypothetical protein  25.42 
 
 
476 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  25.05 
 
 
476 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2709  hypothetical protein  25.42 
 
 
476 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2722  hypothetical protein  25 
 
 
476 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000210589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  33.47 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  38.74 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  33.01 
 
 
999 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  33.01 
 
 
999 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  31.27 
 
 
972 aa  93.2  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  36.92 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  32.04 
 
 
999 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  32.79 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.91 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  32.78 
 
 
908 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  30.42 
 
 
1138 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
800 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  36.6 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  31.38 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  32.32 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 
1200 aa  84  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  35.57 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  30.46 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.15 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  27.38 
 
 
1132 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  34.02 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.7 
 
 
945 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  30.17 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  32.47 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  29.11 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 
530 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  32.99 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.05 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  29.88 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  34.36 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.4 
 
 
809 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.46 
 
 
729 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  32.09 
 
 
343 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  28.26 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  31.76 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.38 
 
 
1444 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  28.72 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.16 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.85 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  30.04 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  30.04 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  37.14 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>