248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1991 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
766 aa  1525    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  43.65 
 
 
748 aa  432  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  35.2 
 
 
676 aa  310  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  47.99 
 
 
469 aa  310  5e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  41.18 
 
 
482 aa  287  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  40.79 
 
 
471 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  44.59 
 
 
400 aa  281  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  32.9 
 
 
875 aa  237  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.31 
 
 
450 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36 
 
 
451 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.57 
 
 
455 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  32.98 
 
 
371 aa  188  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.59 
 
 
427 aa  181  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.4 
 
 
387 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.9 
 
 
396 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.56 
 
 
367 aa  168  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  33.8 
 
 
422 aa  167  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.75 
 
 
414 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.17 
 
 
460 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.85 
 
 
388 aa  153  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  32.21 
 
 
419 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  28.75 
 
 
461 aa  144  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  28.78 
 
 
475 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.55 
 
 
388 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.92 
 
 
392 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.94 
 
 
403 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.46 
 
 
442 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  28.8 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  31.09 
 
 
712 aa  120  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2740  hypothetical protein  55 
 
 
478 aa  114  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.69 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5199  blue (type 1) copper domain protein  55.88 
 
 
215 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.95 
 
 
570 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  26.57 
 
 
342 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  27.27 
 
 
2172 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  27.22 
 
 
585 aa  108  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  28.43 
 
 
841 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  25.33 
 
 
476 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  25 
 
 
476 aa  101  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  24.89 
 
 
476 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  30.28 
 
 
999 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  30.28 
 
 
999 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  28.65 
 
 
999 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2524  hypothetical protein  24.89 
 
 
476 aa  98.2  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2709  hypothetical protein  24.89 
 
 
476 aa  98.2  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
520 aa  98.2  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2738  hypothetical protein  25 
 
 
476 aa  98.2  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2722  hypothetical protein  24.67 
 
 
476 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000210589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2774  hypothetical protein  24.45 
 
 
476 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2581  hypothetical protein  24.11 
 
 
476 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0061  blue (type 1) copper domain protein  49.52 
 
 
171 aa  95.5  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  24.01 
 
 
476 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  42.42 
 
 
1057 aa  94  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0060  blue (type 1) copper domain protein  42.54 
 
 
318 aa  93.2  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0674  blue (type 1) copper domain protein  46.09 
 
 
534 aa  89  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4336  blue (type 1) copper domain protein  44.12 
 
 
197 aa  89  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  26.54 
 
 
1029 aa  88.6  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.08 
 
 
1657 aa  87.8  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1878  hypothetical protein  48.18 
 
 
188 aa  87.4  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  29.07 
 
 
363 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  27.55 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  26.28 
 
 
366 aa  82  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  25.66 
 
 
488 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.85 
 
 
369 aa  80.5  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  27.52 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1774  hypothetical protein  42.48 
 
 
194 aa  79.7  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  29.17 
 
 
394 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  28.96 
 
 
357 aa  79  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  24.75 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0275  hypothetical protein  43.24 
 
 
169 aa  78.2  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 
407 aa  77  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3525  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0529642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  32.57 
 
 
399 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  31.09 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.05 
 
 
1200 aa  75.1  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.23 
 
 
729 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0446  hypothetical protein  46.08 
 
 
223 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1834  blue (type 1) copper domain protein  39.87 
 
 
183 aa  73.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  28.51 
 
 
398 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1528  hypothetical protein  35.76 
 
 
152 aa  73.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  28.21 
 
 
908 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  28.51 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  33.77 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  27.91 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  26.03 
 
 
381 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  26.55 
 
 
366 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  25.55 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  24.4 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  24.05 
 
 
530 aa  69.3  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  26.76 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  26.21 
 
 
1138 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.73 
 
 
809 aa  68.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3800  hypothetical protein  40.78 
 
 
170 aa  68.9  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  24.4 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  25.17 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  26.99 
 
 
392 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  23.68 
 
 
397 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  28.63 
 
 
377 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  27.6 
 
 
369 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>