More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2208 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  42.04 
 
 		 941 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  100 
 
 		 908 aa  1864    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  51.73 
 
 		 1138 aa  884    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  42.18 
 
 		 1151 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  41.12 
 
 		 1135 aa  633  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  41.93 
 
 		 1143 aa  635  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  39.34 
 
 		 1142 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  37.73 
 
 		 909 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  39.84 
 
 		 918 aa  579  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  39.56 
 
 		 984 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  40.09 
 
 		 918 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  39.17 
 
 		 1182 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.34 
 
 		 1200 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.65 
 
 		 1505 aa  432  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.81 
 
 		 953 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  38.66 
 
 		 1444 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 800 aa  362  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.38 
 
 		 945 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  31.79 
 
 		 1194 aa  227  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.23 
 
 		 1657 aa  150  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.87 
 
 		 1029 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  27.97 
 
 		 1081 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  32.12 
 
 		 394 aa  111  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.12 
 
 		 369 aa  111  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.63 
 
 		 396 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.58 
 
 		 408 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  26.19 
 
 		 841 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.31 
 
 		 442 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 422 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  27.32 
 
 		 411 aa  102  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.48 
 
 		 450 aa  102  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  26.59 
 
 		 585 aa  101  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.68 
 
 		 387 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  24.53 
 
 		 712 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  26.7 
 
 		 342 aa  97.8  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.68 
 
 		 414 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  97.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.79 
 
 		 809 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  24.2 
 
 		 999 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  24.39 
 
 		 999 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  24.39 
 
 		 999 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  33.62 
 
 		 461 aa  94  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.4 
 
 		 400 aa  94  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  28.53 
 
 		 471 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 482 aa  91.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  26.65 
 
 		 366 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  24.56 
 
 		 1132 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.08 
 
 		 520 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  27.99 
 
 		 2172 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  32.29 
 
 		 676 aa  89  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  30.74 
 
 		 381 aa  88.6  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  32.78 
 
 		 400 aa  88.6  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  25.06 
 
 		 387 aa  88.2  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  28.33 
 
 		 374 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.33 
 
 		 374 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.15 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  31.87 
 
 		 399 aa  86.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.21 
 
 		 360 aa  86.3  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25.35 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  28.78 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.74 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  25.62 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.64 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  25.94 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.3 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  27.05 
 
 		 388 aa  84.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  29.14 
 
 		 385 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  28.93 
 
 		 385 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.82 
 
 		 412 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  27.24 
 
 		 395 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  27.24 
 
 		 395 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 110 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  31.47 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  25.84 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  26.69 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  24.07 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  27.14 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 117 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.74 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 117 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  41.24 
 
 		 117 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 120 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  28.67 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  30.29 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  34.72 
 
 		 410 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 106 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 392 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 118 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  26.62 
 
 		 369 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  25.44 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 116 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  26.25 
 
 		 383 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  27.44 
 
 		 367 aa  80.1  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.62 
 
 		 427 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  28.31 
 
 		 363 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  25.98 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  41.25 
 
 		 119 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  41.25 
 
 		 119 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  26.8 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>