More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1484 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  41.2 
 
 		 1135 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  43.09 
 
 		 1143 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  67.09 
 
 		 984 aa  1324    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  45.14 
 
 		 1142 aa  827    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  100 
 
 		 918 aa  1890    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  49.34 
 
 		 1151 aa  838    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  47.91 
 
 		 941 aa  845    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  40.83 
 
 		 1138 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  38.58 
 
 		 918 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  38.17 
 
 		 909 aa  609  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  39.84 
 
 		 908 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  37.85 
 
 		 1182 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.33 
 
 		 1505 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.08 
 
 		 1200 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  38.42 
 
 		 1444 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.29 
 
 		 945 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.45 
 
 		 953 aa  340  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 800 aa  331  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  33.62 
 
 		 1194 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  25.91 
 
 		 1029 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.54 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  33.58 
 
 		 413 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  26.33 
 
 		 374 aa  108  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  24.23 
 
 		 1081 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  23.94 
 
 		 999 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  23.94 
 
 		 999 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  27.69 
 
 		 382 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  29.81 
 
 		 407 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  23.97 
 
 		 999 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  25.47 
 
 		 383 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  28.07 
 
 		 387 aa  104  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  27.18 
 
 		 381 aa  104  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  30.19 
 
 		 387 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  31.5 
 
 		 394 aa  103  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  24.87 
 
 		 841 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.41 
 
 		 2172 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  22.64 
 
 		 892 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  30.18 
 
 		 387 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 		 412 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.5 
 
 		 369 aa  102  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  29.65 
 
 		 391 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  25.75 
 
 		 388 aa  101  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  31.49 
 
 		 419 aa  100  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 428 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  27.53 
 
 		 381 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  25.18 
 
 		 381 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 428 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  26.44 
 
 		 381 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.03 
 
 		 392 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 399 aa  98.6  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  24.27 
 
 		 1132 aa  98.2  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.87 
 
 		 377 aa  98.2  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.19 
 
 		 366 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 		 377 aa  97.8  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  29.81 
 
 		 405 aa  97.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  27.3 
 
 		 387 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  22.5 
 
 		 1657 aa  96.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  25.42 
 
 		 382 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  25.18 
 
 		 432 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  24.71 
 
 		 388 aa  95.5  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  25.66 
 
 		 383 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  29.17 
 
 		 411 aa  94  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  27.68 
 
 		 371 aa  94  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.45 
 
 		 374 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 		 382 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.45 
 
 		 374 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  29.29 
 
 		 380 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  41.58 
 
 		 118 aa  92.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  24.15 
 
 		 972 aa  92.8  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  28.36 
 
 		 375 aa  92.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.04 
 
 		 430 aa  91.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.68 
 
 		 379 aa  90.5  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  28.36 
 
 		 585 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.45 
 
 		 570 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  27.61 
 
 		 386 aa  90.9  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  25.49 
 
 		 378 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  26.48 
 
 		 395 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  29.7 
 
 		 376 aa  90.5  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  28.94 
 
 		 408 aa  90.1  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 410 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  26.48 
 
 		 395 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  25.06 
 
 		 382 aa  89  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.89 
 
 		 392 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  26.27 
 
 		 400 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.74 
 
 		 809 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  27.65 
 
 		 392 aa  88.6  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  25.72 
 
 		 461 aa  88.6  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  26.13 
 
 		 388 aa  88.6  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  28.79 
 
 		 396 aa  88.2  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 		 387 aa  88.2  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.04 
 
 		 455 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.62 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.45 
 
 		 406 aa  86.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  25.6 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  28.68 
 
 		 384 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.74 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.74 
 
 		 450 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.49 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  28.3 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  25.3 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>