More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4672 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  45.71 
 
 		 1135 aa  777    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  45.2 
 
 		 909 aa  716    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  53.41 
 
 		 1151 aa  957    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  47.91 
 
 		 918 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  48.11 
 
 		 984 aa  842    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  42.54 
 
 		 1182 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  43.96 
 
 		 1138 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  48.94 
 
 		 1143 aa  813    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  43.7 
 
 		 918 aa  698    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  100 
 
 		 941 aa  1945    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  42.04 
 
 		 908 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  54.76 
 
 		 1142 aa  971    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.79 
 
 		 1200 aa  509  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.23 
 
 		 1505 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  43.66 
 
 		 1444 aa  452  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.62 
 
 		 945 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.11 
 
 		 953 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 800 aa  357  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  32.29 
 
 		 1194 aa  253  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.65 
 
 		 1029 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.83 
 
 		 1657 aa  137  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.33 
 
 		 892 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  26.46 
 
 		 841 aa  112  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.17 
 
 		 394 aa  111  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.7 
 
 		 369 aa  110  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  25.3 
 
 		 999 aa  109  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  26.28 
 
 		 1081 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  25.64 
 
 		 999 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  25.64 
 
 		 999 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 388 aa  105  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 388 aa  105  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  25.58 
 
 		 411 aa  104  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  26.61 
 
 		 387 aa  101  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  27.21 
 
 		 413 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  26.45 
 
 		 392 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  27.25 
 
 		 387 aa  97.8  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.18 
 
 		 442 aa  97.8  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28 
 
 		 396 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.02 
 
 		 412 aa  95.9  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 		 377 aa  95.5  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  25.28 
 
 		 585 aa  95.5  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  27.68 
 
 		 430 aa  94.7  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  27.5 
 
 		 377 aa  94.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  31.25 
 
 		 419 aa  94  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.37 
 
 		 374 aa  94  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.54 
 
 		 360 aa  93.6  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.37 
 
 		 374 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  26.87 
 
 		 407 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  26.13 
 
 		 381 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  23.82 
 
 		 712 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  23.15 
 
 		 387 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  28.36 
 
 		 376 aa  91.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 399 aa  91.3  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  25.24 
 
 		 374 aa  91.3  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 		 391 aa  91.3  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  26.67 
 
 		 381 aa  91.3  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  25.39 
 
 		 387 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  28.52 
 
 		 422 aa  90.5  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  25.06 
 
 		 366 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28 
 
 		 382 aa  90.9  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  29.81 
 
 		 408 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.02 
 
 		 2172 aa  89.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  31.29 
 
 		 410 aa  89.7  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  24.25 
 
 		 1132 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  26.21 
 
 		 378 aa  89.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  26.56 
 
 		 383 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.68 
 
 		 570 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.29 
 
 		 809 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  22.66 
 
 		 342 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  26.04 
 
 		 383 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  24.53 
 
 		 530 aa  88.2  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 403 aa  88.2  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  26.1 
 
 		 465 aa  88.2  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  50.6 
 
 		 118 aa  88.2  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  26.77 
 
 		 381 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.29 
 
 		 387 aa  87.8  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.6 
 
 		 367 aa  87.4  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  22.73 
 
 		 395 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  49.35 
 
 		 138 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  23.95 
 
 		 392 aa  87  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  28.44 
 
 		 471 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  28.99 
 
 		 375 aa  86.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  25.9 
 
 		 382 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  22.5 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  24.65 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  29.18 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  28.99 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  25.07 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  27.44 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  27.93 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  25.23 
 
 		 387 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 117 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  24.39 
 
 		 376 aa  84.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  24.91 
 
 		 382 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 117 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 117 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  26.94 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.91 
 
 		 520 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  25.97 
 
 		 381 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.16 
 
 		 450 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>