More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4030 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  44.22 
 
 		 1135 aa  927    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  43.89 
 
 		 1151 aa  919    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.3 
 
 		 1505 aa  685    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  42.54 
 
 		 941 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  45.99 
 
 		 1143 aa  1007    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1182 aa  2446    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  49.72 
 
 		 918 aa  852    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  43.95 
 
 		 1138 aa  890    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  43.65 
 
 		 1142 aa  902    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  40.66 
 
 		 1200 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  41.72 
 
 		 1444 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  38.59 
 
 		 909 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  38.8 
 
 		 984 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 800 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  37.85 
 
 		 918 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  39.17 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.85 
 
 		 945 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  31.44 
 
 		 1194 aa  363  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.85 
 
 		 953 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 245 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 272 aa  261  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 232 aa  249  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  55.91 
 
 		 392 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  46.22 
 
 		 247 aa  212  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  44.26 
 
 		 260 aa  209  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  38.87 
 
 		 279 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  45.91 
 
 		 276 aa  201  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  40.99 
 
 		 275 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  41.89 
 
 		 895 aa  179  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  41.89 
 
 		 255 aa  178  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 277 aa  169  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  39.08 
 
 		 285 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  26.8 
 
 		 1029 aa  155  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1081 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  34.31 
 
 		 375 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.16 
 
 		 1657 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  29.81 
 
 		 346 aa  115  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  32.48 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  23.67 
 
 		 841 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  25.22 
 
 		 999 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  25.22 
 
 		 999 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.97 
 
 		 585 aa  106  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  24.69 
 
 		 999 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  26.87 
 
 		 387 aa  105  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.17 
 
 		 396 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  26.08 
 
 		 387 aa  104  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  23.1 
 
 		 1132 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  28.24 
 
 		 342 aa  103  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  36.42 
 
 		 410 aa  103  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  30.5 
 
 		 2172 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  29.55 
 
 		 391 aa  102  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 		 387 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.62 
 
 		 412 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  25.76 
 
 		 366 aa  100  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  28.67 
 
 		 383 aa  99.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  30.94 
 
 		 413 aa  99.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  23.94 
 
 		 712 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.74 
 
 		 442 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  24.73 
 
 		 388 aa  96.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 		 376 aa  96.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.96 
 
 		 369 aa  95.1  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  28.29 
 
 		 394 aa  95.1  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  24.82 
 
 		 388 aa  95.1  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  28.97 
 
 		 392 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  25.06 
 
 		 408 aa  94.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  29.34 
 
 		 408 aa  93.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  25.53 
 
 		 374 aa  93.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  29.41 
 
 		 413 aa  94  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  29.85 
 
 		 263 aa  92.8  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.79 
 
 		 387 aa  93.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  30.22 
 
 		 422 aa  93.2  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25.44 
 
 		 430 aa  93.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  24.65 
 
 		 407 aa  93.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.62 
 
 		 387 aa  91.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  30.96 
 
 		 371 aa  91.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  27.94 
 
 		 382 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 381 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  29.5 
 
 		 382 aa  90.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  25.17 
 
 		 405 aa  90.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  27.85 
 
 		 376 aa  89.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  26.97 
 
 		 386 aa  89.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  23.09 
 
 		 972 aa  89.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  21.78 
 
 		 892 aa  89.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  28.43 
 
 		 419 aa  89  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  30.32 
 
 		 367 aa  89  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  27.34 
 
 		 399 aa  89  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  26.9 
 
 		 387 aa  88.6  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 		 369 aa  88.6  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  27.57 
 
 		 381 aa  88.6  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  27.65 
 
 		 382 aa  88.6  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  23.74 
 
 		 428 aa  88.6  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  28.77 
 
 		 461 aa  88.6  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.88 
 
 		 360 aa  88.2  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  27.57 
 
 		 381 aa  88.2  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 374 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 374 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  26.79 
 
 		 394 aa  87.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.81 
 
 		 378 aa  86.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  24.67 
 
 		 403 aa  87.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  23.52 
 
 		 428 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>