170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7911 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  787    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  69 
 
 		 1505 aa  322  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 232 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  54.65 
 
 		 1444 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  52.28 
 
 		 1138 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 272 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.84 
 
 		 245 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  56.19 
 
 		 1143 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  88.65 
 
 		 953 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  55.91 
 
 		 1182 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  54.17 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  49.56 
 
 		 1135 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  50 
 
 		 895 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  45.82 
 
 		 1151 aa  222  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  47.08 
 
 		 1142 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 800 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  45.64 
 
 		 247 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.63 
 
 		 1200 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  43.04 
 
 		 279 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  40.73 
 
 		 260 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  43.3 
 
 		 255 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  39.63 
 
 		 275 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  40.87 
 
 		 1194 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  41.2 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  36.05 
 
 		 285 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  36.86 
 
 		 292 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  36.02 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  58.21 
 
 		 588 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.62 
 
 		 674 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  53.91 
 
 		 571 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  51.18 
 
 		 637 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  51.11 
 
 		 987 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  49.19 
 
 		 1441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  50.81 
 
 		 1070 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  53.54 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 962 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  54.55 
 
 		 999 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  50.35 
 
 		 578 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  51.26 
 
 		 1103 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  51.18 
 
 		 581 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  52.34 
 
 		 452 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.77 
 
 		 756 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.46 
 
 		 639 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.23 
 
 		 815 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  50.39 
 
 		 850 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  53.54 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.41 
 
 		 755 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.17 
 
 		 1158 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  47.06 
 
 		 801 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.61 
 
 		 722 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.35 
 
 		 929 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 		 752 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.24 
 
 		 1007 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.42 
 
 		 1117 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.87 
 
 		 940 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.11 
 
 		 819 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.27 
 
 		 984 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  49.61 
 
 		 1059 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  35.16 
 
 		 732 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.03 
 
 		 971 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.96 
 
 		 1321 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  43.42 
 
 		 558 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  43.51 
 
 		 1581 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.92 
 
 		 729 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  41.61 
 
 		 1059 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.46 
 
 		 578 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.83 
 
 		 915 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  30.68 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50 
 
 		 695 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  47.5 
 
 		 4013 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  29.07 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.04 
 
 		 1564 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.35 
 
 		 471 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  43.61 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.61 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.86 
 
 		 480 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.86 
 
 		 472 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.86 
 
 		 472 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  32.64 
 
 		 475 aa  96.3  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  45.19 
 
 		 879 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  46.08 
 
 		 1338 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  28.35 
 
 		 266 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 1332 aa  93.2  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 		 1362 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  29.39 
 
 		 255 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.86 
 
 		 470 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  27.97 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  39.85 
 
 		 470 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.23 
 
 		 1139 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  40.77 
 
 		 1028 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.11 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  25.98 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  37.06 
 
 		 1471 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.83 
 
 		 112 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.19 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 601 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  32.34 
 
 		 219 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  32.28 
 
 		 1061 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>