47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0069 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  581  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  47.25 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  39.57 
 
 		 1143 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  37.34 
 
 		 1182 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  37.07 
 
 		 1138 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  36.69 
 
 		 1135 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  38.6 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  36.59 
 
 		 895 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.07 
 
 		 1505 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 1151 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  34.35 
 
 		 1142 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 800 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.51 
 
 		 1444 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  32.41 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  32.83 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  30.98 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  35.22 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.51 
 
 		 1200 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  31.58 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  30.13 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  26.81 
 
 		 1194 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  26.77 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  27.17 
 
 		 346 aa  97.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  27.73 
 
 		 375 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  27.04 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  29.52 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  24.69 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  27.07 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.22 
 
 		 1180 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  25.12 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  26.99 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.28 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 601 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  24.16 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.4 
 
 		 1171 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  25.1 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  26.7 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  24.73 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  25.62 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  23.26 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  24.24 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.21 
 
 		 1503 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  21.43 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.11 
 
 		 478 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>