35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6776 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 273 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  70.08 
 
 		 268 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  64.81 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  55.95 
 
 		 639 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.78 
 
 		 601 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  29.15 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  28.27 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  31.16 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  27.17 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  26.42 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.24 
 
 		 1444 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  27.42 
 
 		 1151 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  26.72 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.34 
 
 		 1505 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.02 
 
 		 1200 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  28.28 
 
 		 1138 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  26.64 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  25.52 
 
 		 1143 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  26.03 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  26.46 
 
 		 1182 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  23.83 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  27.51 
 
 		 895 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  27.59 
 
 		 1142 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  25.64 
 
 		 1135 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  27.16 
 
 		 1194 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  29.6 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  23.26 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  26.6 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 800 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.53 
 
 		 1171 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  25.38 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>