23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1628 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  640    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  45.38 
 
 		 1439 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  25.4 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.64 
 
 		 1265 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.76 
 
 		 1180 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.32 
 
 		 1274 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.9 
 
 		 478 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  24.69 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  30.63 
 
 		 266 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  24.47 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  30.43 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  24.05 
 
 		 1143 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  25.44 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  20.94 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  30.34 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  33.73 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.06 
 
 		 1171 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  21.6 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  24.23 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  27.47 
 
 		 1135 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  25 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  31.4 
 
 		 1138 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>