167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1957 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  100 
 
 		 1439 aa  2972    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  37.52 
 
 		 880 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  37.3 
 
 		 874 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  45.38 
 
 		 308 aa  223  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  22.63 
 
 		 1137 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.96 
 
 		 1027 aa  141  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  22.51 
 
 		 1143 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.88 
 
 		 1040 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  24.86 
 
 		 1141 aa  121  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.9 
 
 		 968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.09 
 
 		 1201 aa  119  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  25.05 
 
 		 1110 aa  118  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.45 
 
 		 1023 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.43 
 
 		 1181 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.55 
 
 		 1162 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.78 
 
 		 1274 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.05 
 
 		 868 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.65 
 
 		 1265 aa  98.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.22 
 
 		 1149 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  26.13 
 
 		 1058 aa  95.1  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  29.54 
 
 		 466 aa  92  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.59 
 
 		 1171 aa  91.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  36.3 
 
 		 1142 aa  90.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.72 
 
 		 1180 aa  87.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  34.81 
 
 		 924 aa  85.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.04 
 
 		 864 aa  83.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  34.21 
 
 		 644 aa  82  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  24.34 
 
 		 1077 aa  78.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.9 
 
 		 1306 aa  78.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  24.27 
 
 		 1139 aa  72.8  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.57 
 
 		 1286 aa  73.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 384 aa  71.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  26.1 
 
 		 392 aa  70.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.25 
 
 		 986 aa  70.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  29.1 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  29.01 
 
 		 898 aa  69.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  26.83 
 
 		 423 aa  67.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  27.04 
 
 		 460 aa  66.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.62 
 
 		 1068 aa  66.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  39.73 
 
 		 850 aa  67  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.64 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.41 
 
 		 705 aa  66.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.46 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  27.42 
 
 		 168 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.16 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  23.49 
 
 		 902 aa  65.1  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.81 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  38.17 
 
 		 1070 aa  64.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  26.72 
 
 		 408 aa  64.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.87 
 
 		 1193 aa  62.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.22 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.57 
 
 		 1503 aa  62  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.4 
 
 		 755 aa  61.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.8 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.15 
 
 		 1088 aa  60.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.83 
 
 		 1390 aa  60.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  32.26 
 
 		 1135 aa  60.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.52 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.91 
 
 		 1084 aa  60.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.4 
 
 		 987 aa  59.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.84 
 
 		 1055 aa  59.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.08 
 
 		 722 aa  59.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.64 
 
 		 1007 aa  59.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.42 
 
 		 4013 aa  58.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.5 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  31.48 
 
 		 447 aa  57.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.39 
 
 		 418 aa  58.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.35 
 
 		 1117 aa  58.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  27.8 
 
 		 801 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  26.17 
 
 		 420 aa  58.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.39 
 
 		 419 aa  58.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  34.48 
 
 		 433 aa  58.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  25.51 
 
 		 546 aa  57.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  25.87 
 
 		 418 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.99 
 
 		 712 aa  57.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.29 
 
 		 953 aa  56.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.61 
 
 		 422 aa  57  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  29.32 
 
 		 1028 aa  56.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 		 951 aa  55.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.35 
 
 		 1158 aa  55.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.08 
 
 		 428 aa  55.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  33.56 
 
 		 1581 aa  55.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.61 
 
 		 674 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.49 
 
 		 379 aa  54.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  26.46 
 
 		 617 aa  53.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  25.36 
 
 		 410 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  27.18 
 
 		 394 aa  53.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.82 
 
 		 962 aa  53.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  32.68 
 
 		 999 aa  52.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.68 
 
 		 391 aa  52.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.54 
 
 		 957 aa  52.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  25.39 
 
 		 1471 aa  52.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.53 
 
 		 581 aa  52.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  30 
 
 		 912 aa  52.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.83 
 
 		 420 aa  52  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.79 
 
 		 427 aa  51.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.79 
 
 		 427 aa  51.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.76 
 
 		 1060 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  30.5 
 
 		 571 aa  51.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>