78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1714 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  50.84 
 
 		 1135 aa  917    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  47.49 
 
 		 927 aa  820    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0280  glycosy hydrolase family protein  50.57 
 
 		 740 aa  717    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 951 aa  1965    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 		 880 aa  559  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  34.11 
 
 		 834 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  36.02 
 
 		 807 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 807 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  31.24 
 
 		 1127 aa  327  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0126  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 586 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0534718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0300  glycoside hydrolase family protein  28.94 
 
 		 592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0279  surface layer protein B  54.29 
 
 		 108 aa  105  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  33.09 
 
 		 899 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  31.94 
 
 		 821 aa  67.8  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.57 
 
 		 454 aa  67  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.33 
 
 		 1300 aa  58.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  31.11 
 
 		 1439 aa  56.2  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.92 
 
 		 712 aa  54.7  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  31.85 
 
 		 1164 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 788 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  37.36 
 
 		 2272 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  37.21 
 
 		 540 aa  52.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  30.18 
 
 		 591 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  38.96 
 
 		 1862 aa  52  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  38.55 
 
 		 2000 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  36.11 
 
 		 690 aa  51.6  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  35.56 
 
 		 1842 aa  51.2  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  28.48 
 
 		 850 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  41.67 
 
 		 471 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  33.33 
 
 		 575 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35.56 
 
 		 1882 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  29.07 
 
 		 1120 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  43.21 
 
 		 940 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  27.91 
 
 		 439 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1682 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  34.48 
 
 		 848 aa  49.7  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  37.8 
 
 		 530 aa  49.3  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  27.01 
 
 		 1070 aa  49.3  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  32.43 
 
 		 1361 aa  48.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1667 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  30.81 
 
 		 685 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  41.56 
 
 		 2122 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.78 
 
 		 1289 aa  47.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.24 
 
 		 688 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.73 
 
 		 644 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  31 
 
 		 820 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  27.23 
 
 		 684 aa  47.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  47.14 
 
 		 1095 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1830 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  40.85 
 
 		 810 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  37.04 
 
 		 675 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  30.16 
 
 		 1236 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1259  PKD domain containing protein  38.98 
 
 		 445 aa  46.2  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.501377  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  42.47 
 
 		 561 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.22 
 
 		 953 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  34.62 
 
 		 1356 aa  46.2  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 840 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  40.54 
 
 		 184 aa  46.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.03 
 
 		 1264 aa  46.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 752 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  31.13 
 
 		 500 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  34.12 
 
 		 2036 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.96 
 
 		 1282 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  32.91 
 
 		 978 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  33.67 
 
 		 838 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  36.59 
 
 		 1387 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.73 
 
 		 1602 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  33.33 
 
 		 1969 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  36.59 
 
 		 1732 aa  45.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 3295 aa  45.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  39.56 
 
 		 2554 aa  45.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  41 
 
 		 861 aa  44.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  41.18 
 
 		 819 aa  44.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  36.17 
 
 		 615 aa  44.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  38.89 
 
 		 1092 aa  44.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.19 
 
 		 478 aa  44.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  37.66 
 
 		 644 aa  44.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  30.33 
 
 		 768 aa  44.3  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>