55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1016 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 880 aa  1783    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  43.66 
 
 		 1135 aa  684    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  40.23 
 
 		 927 aa  631  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 		 951 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0280  glycosy hydrolase family protein  42.36 
 
 		 740 aa  515  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  36.34 
 
 		 1127 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  31.35 
 
 		 834 aa  351  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 807 aa  351  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 		 807 aa  345  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0300  glycoside hydrolase family protein  26.66 
 
 		 592 aa  195  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0126  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 586 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0534718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  40.58 
 
 		 899 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.57 
 
 		 454 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  40.29 
 
 		 1164 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0279  surface layer protein B  50.96 
 
 		 108 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.75 
 
 		 356 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0487  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.51 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.51 
 
 		 712 aa  66.6  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.97 
 
 		 350 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.03 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  35.64 
 
 		 821 aa  65.9  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.25 
 
 		 971 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  29.03 
 
 		 1070 aa  58.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 		 752 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  29.84 
 
 		 850 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.93 
 
 		 1448 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  36.62 
 
 		 788 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.67 
 
 		 1038 aa  54.7  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  30.57 
 
 		 1471 aa  54.3  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  31.15 
 
 		 1581 aa  52.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  31.3 
 
 		 571 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.8 
 
 		 838 aa  51.6  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  29.41 
 
 		 879 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.22 
 
 		 915 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.07 
 
 		 984 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 578 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1667 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.66 
 
 		 1007 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  27.95 
 
 		 801 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  36.9 
 
 		 1236 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.03 
 
 		 756 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.25 
 
 		 755 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.29 
 
 		 1059 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  30.86 
 
 		 540 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.87 
 
 		 644 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.79 
 
 		 1321 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.3 
 
 		 722 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  36.78 
 
 		 978 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.12 
 
 		 1362 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  35.96 
 
 		 1092 aa  45.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.62 
 
 		 674 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  32.94 
 
 		 1120 aa  44.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.22 
 
 		 815 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.04 
 
 		 1264 aa  44.3  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  29.45 
 
 		 732 aa  44.3  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>