64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0279 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0279  surface layer protein B  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  97.14 
 
 		 1135 aa  204  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  54.29 
 
 		 951 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  49.51 
 
 		 927 aa  95.5  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  50.96 
 
 		 880 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  46 
 
 		 1292 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  61.54 
 
 		 713 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  56.1 
 
 		 1667 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  60 
 
 		 791 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  45.45 
 
 		 2122 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  48.89 
 
 		 1882 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  54.76 
 
 		 3295 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  55 
 
 		 848 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  50 
 
 		 821 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  55 
 
 		 1682 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  59.46 
 
 		 679 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  54.76 
 
 		 838 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  56.41 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  49.06 
 
 		 1120 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  55 
 
 		 675 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  53.66 
 
 		 561 aa  43.9  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  54.55 
 
 		 528 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  49.18 
 
 		 1328 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  53.85 
 
 		 551 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  37.97 
 
 		 2554 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  38.67 
 
 		 587 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  56.76 
 
 		 669 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 910 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  52.5 
 
 		 1842 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.38 
 
 		 1001 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  48.89 
 
 		 1092 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  34.58 
 
 		 1143 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  42.86 
 
 		 1862 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  48.78 
 
 		 1830 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  53.33 
 
 		 978 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  55.56 
 
 		 615 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  43.86 
 
 		 2272 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  53.33 
 
 		 575 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  48.78 
 
 		 2036 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  41.1 
 
 		 460 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  48 
 
 		 1300 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  50 
 
 		 1282 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  44.83 
 
 		 788 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  55.56 
 
 		 1969 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  52.5 
 
 		 2000 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  52.5 
 
 		 1732 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  51.28 
 
 		 1241 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  36.36 
 
 		 1361 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  51.22 
 
 		 859 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  55 
 
 		 1667 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.35 
 
 		 1007 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  51.22 
 
 		 735 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.68 
 
 		 962 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  52.78 
 
 		 685 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.78 
 
 		 930 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  42.86 
 
 		 1059 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  51.28 
 
 		 547 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  38.71 
 
 		 987 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  46.81 
 
 		 941 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  52.78 
 
 		 581 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  52.5 
 
 		 1356 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  53.85 
 
 		 530 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  52.5 
 
 		 752 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  42.86 
 
 		 1439 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>