273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5116 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  100 
 
 		 1059 aa  2170    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.6 
 
 		 819 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  40.52 
 
 		 1441 aa  326  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.35 
 
 		 1707 aa  261  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  43.7 
 
 		 383 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  40.84 
 
 		 279 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  40 
 
 		 409 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  41.49 
 
 		 389 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  39.31 
 
 		 641 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  39.31 
 
 		 642 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.98 
 
 		 627 aa  173  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.81 
 
 		 633 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.19 
 
 		 252 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  35.16 
 
 		 467 aa  164  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  38.34 
 
 		 291 aa  164  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  38.93 
 
 		 274 aa  164  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  39 
 
 		 1152 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.19 
 
 		 915 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  35.36 
 
 		 883 aa  160  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.31 
 
 		 1290 aa  159  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  37.82 
 
 		 588 aa  158  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  36.26 
 
 		 281 aa  153  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  59.7 
 
 		 801 aa  154  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 301 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.1 
 
 		 1694 aa  151  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 		 556 aa  151  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  36.04 
 
 		 286 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 1332 aa  148  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.69 
 
 		 423 aa  148  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 		 503 aa  147  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.26 
 
 		 288 aa  144  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  36.67 
 
 		 283 aa  144  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.64 
 
 		 282 aa  141  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  35.23 
 
 		 276 aa  141  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1406 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.08 
 
 		 426 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  35.38 
 
 		 289 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  33.46 
 
 		 1028 aa  138  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  34.41 
 
 		 752 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.57 
 
 		 569 aa  134  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  31.19 
 
 		 291 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 1321 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  30.77 
 
 		 330 aa  131  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 469 aa  129  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 		 286 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.88 
 
 		 547 aa  128  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.6 
 
 		 306 aa  128  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.37 
 
 		 532 aa  124  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  31.5 
 
 		 286 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.05 
 
 		 884 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  31.82 
 
 		 405 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 384 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 		 674 aa  122  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.25 
 
 		 1139 aa  121  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.32 
 
 		 290 aa  121  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.69 
 
 		 1007 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.98 
 
 		 328 aa  119  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.66 
 
 		 755 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.8 
 
 		 815 aa  117  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  29.07 
 
 		 328 aa  117  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.07 
 
 		 358 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 		 427 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.97 
 
 		 953 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 		 962 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 261 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.52 
 
 		 315 aa  114  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 694 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  42.38 
 
 		 571 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  44.53 
 
 		 637 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.49 
 
 		 742 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.85 
 
 		 756 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  41.6 
 
 		 392 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.65 
 
 		 912 aa  108  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  46.51 
 
 		 452 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  48.06 
 
 		 1581 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  29.69 
 
 		 275 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  45.24 
 
 		 987 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.6 
 
 		 1158 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 394 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.27 
 
 		 1564 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  44.93 
 
 		 558 aa  106  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  35.45 
 
 		 1123 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  31.91 
 
 		 238 aa  104  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  43.44 
 
 		 850 aa  104  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 		 578 aa  104  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 1918 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.26 
 
 		 639 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  32.1 
 
 		 271 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 269 aa  100  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.59 
 
 		 929 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  40.46 
 
 		 4013 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  40.31 
 
 		 433 aa  98.2  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  40.88 
 
 		 732 aa  97.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  32.31 
 
 		 1053 aa  97.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  36.7 
 
 		 846 aa  97.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  31.36 
 
 		 464 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  44.09 
 
 		 879 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  40.8 
 
 		 1070 aa  95.1  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 		 308 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  31 
 
 		 846 aa  92  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>