158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3687 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
674 aa  1362    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  66.67 
 
 
962 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.3 
 
 
578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.81 
 
 
581 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  68.49 
 
 
987 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.71 
 
 
1158 aa  356  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  56.81 
 
 
850 aa  327  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  74.33 
 
 
815 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  54.22 
 
 
588 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  48.11 
 
 
752 aa  267  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  43.67 
 
 
1581 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  44.71 
 
 
1441 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.12 
 
 
915 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.67 
 
 
1564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  60.34 
 
 
433 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  75.97 
 
 
1007 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  41.46 
 
 
4013 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  73.02 
 
 
755 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  43.06 
 
 
1028 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.02 
 
 
1362 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  56.79 
 
 
571 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  68.61 
 
 
449 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.12 
 
 
722 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  42.32 
 
 
578 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  72.36 
 
 
639 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.99 
 
 
756 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  59.24 
 
 
999 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 
1471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  56.56 
 
 
953 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  58.21 
 
 
452 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  55.08 
 
 
392 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  48.48 
 
 
637 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.78 
 
 
929 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  52.71 
 
 
1070 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 
1184 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.8 
 
 
1321 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.83 
 
 
819 aa  127  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  51.45 
 
 
471 aa  122  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  42.86 
 
 
1059 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  45.6 
 
 
732 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  42.94 
 
 
801 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.55 
 
 
729 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.17 
 
 
971 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  49.09 
 
 
622 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.38 
 
 
480 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  52.63 
 
 
487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.63 
 
 
487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  49.6 
 
 
879 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  57.8 
 
 
1016 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  39.51 
 
 
558 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  55.05 
 
 
1338 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  53.85 
 
 
1103 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.83 
 
 
1117 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.74 
 
 
472 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.74 
 
 
472 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  53.62 
 
 
470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  54.96 
 
 
475 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.27 
 
 
984 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.24 
 
 
1139 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  51.94 
 
 
1059 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.52 
 
 
1448 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50.72 
 
 
470 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  63.64 
 
 
688 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50 
 
 
470 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.79 
 
 
1072 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  56.57 
 
 
1148 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
1332 aa  97.4  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  58.56 
 
 
884 aa  97.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  60.87 
 
 
672 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  59.29 
 
 
726 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.59 
 
 
1060 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.97 
 
 
933 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  27.92 
 
 
768 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  38.84 
 
 
722 aa  90.9  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  62.86 
 
 
788 aa  90.5  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  60.44 
 
 
824 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.69 
 
 
695 aa  88.2  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  62.89 
 
 
753 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.98 
 
 
820 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  66.2 
 
 
778 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  38.65 
 
 
2117 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  27.44 
 
 
557 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.54 
 
 
929 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  63.24 
 
 
710 aa  74.7  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  26.82 
 
 
726 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.86 
 
 
538 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.06 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  32.99 
 
 
1213 aa  71.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.19 
 
 
597 aa  71.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  32.89 
 
 
818 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  55.56 
 
 
840 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.51 
 
 
1038 aa  70.1  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  35.33 
 
 
899 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  37.4 
 
 
644 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  69.33 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.33 
 
 
112 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  31.97 
 
 
1061 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  28.32 
 
 
873 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  34.5 
 
 
1200 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  25 
 
 
884 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>