55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0136 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  100 
 
 
622 aa  1241    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  65.92 
 
 
753 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.09 
 
 
674 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.74 
 
 
815 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  67.78 
 
 
1016 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.62 
 
 
962 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  55.56 
 
 
1148 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  45.05 
 
 
884 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  63.46 
 
 
494 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  39.91 
 
 
788 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  67.07 
 
 
688 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  61.05 
 
 
726 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.69 
 
 
1072 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.61 
 
 
933 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  58.25 
 
 
3244 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  58.06 
 
 
672 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  58.24 
 
 
824 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  63.86 
 
 
778 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  56.18 
 
 
2079 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  45.83 
 
 
840 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  56.34 
 
 
1779 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  46.59 
 
 
1338 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.59 
 
 
1321 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  32.11 
 
 
710 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.4 
 
 
597 aa  67.4  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  60.53 
 
 
518 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  43.18 
 
 
2402 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  31.15 
 
 
586 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  43.01 
 
 
1879 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
692 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  30.36 
 
 
1030 aa  52  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  40.66 
 
 
1728 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 
583 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  36.14 
 
 
3563 aa  50.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  40.91 
 
 
2337 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  46.27 
 
 
8321 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  62.5 
 
 
592 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.19 
 
 
1673 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.92 
 
 
887 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.62 
 
 
3699 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  33.62 
 
 
3699 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  28.41 
 
 
691 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  36.36 
 
 
2271 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  36.36 
 
 
2271 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  37.36 
 
 
1025 aa  48.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4441  hypothetical protein  28.57 
 
 
314 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  46.15 
 
 
2636 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  41.1 
 
 
2031 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.67 
 
 
3544 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  30.57 
 
 
1055 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  50 
 
 
1991 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  36.8 
 
 
3542 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  34.94 
 
 
2802 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.3 
 
 
1019 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  33.67 
 
 
2522 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>