227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3395 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
1448 aa  2883    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  59.13 
 
 
1200 aa  1195    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  41.8 
 
 
1213 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  29.8 
 
 
1091 aa  230  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  31.79 
 
 
1000 aa  219  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.61 
 
 
1212 aa  204  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.26 
 
 
1410 aa  196  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  29.43 
 
 
675 aa  179  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  30.15 
 
 
671 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  28.29 
 
 
1085 aa  173  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.67 
 
 
584 aa  168  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.57 
 
 
795 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  28.28 
 
 
1418 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  60 
 
 
1109 aa  159  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  58.09 
 
 
510 aa  155  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.71 
 
 
823 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  58.09 
 
 
933 aa  153  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  27.69 
 
 
981 aa  141  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.25 
 
 
1001 aa  138  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.33 
 
 
6885 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.13 
 
 
729 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  45.3 
 
 
743 aa  112  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  42.01 
 
 
2170 aa  112  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  36.9 
 
 
455 aa  106  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 
752 aa  105  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  36.9 
 
 
455 aa  104  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  36.9 
 
 
455 aa  104  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  38.83 
 
 
455 aa  102  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  36.96 
 
 
455 aa  102  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  36.41 
 
 
455 aa  102  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  36.7 
 
 
455 aa  102  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  37.77 
 
 
455 aa  102  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  35.29 
 
 
455 aa  100  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.13 
 
 
208 aa  100  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  39.89 
 
 
455 aa  100  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  35.29 
 
 
455 aa  100  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  46.2 
 
 
973 aa  98.6  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  37.57 
 
 
458 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  36.96 
 
 
680 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.1 
 
 
1158 aa  96.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  38.83 
 
 
458 aa  96.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.23 
 
 
674 aa  95.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.23 
 
 
962 aa  95.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  36.65 
 
 
456 aa  95.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  39.8 
 
 
1887 aa  94.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  38.28 
 
 
614 aa  93.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  30.99 
 
 
987 aa  92.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.34 
 
 
685 aa  92  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  36.51 
 
 
459 aa  91.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.68 
 
 
578 aa  89.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 
809 aa  89.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.25 
 
 
1564 aa  88.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.55 
 
 
581 aa  88.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  40 
 
 
2334 aa  86.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
578 aa  84.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  40.69 
 
 
561 aa  84  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.76 
 
 
1362 aa  83.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  34.03 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  28.23 
 
 
588 aa  82.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.56 
 
 
815 aa  82.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.12 
 
 
915 aa  82  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.41 
 
 
762 aa  79.7  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  31.76 
 
 
850 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  27.72 
 
 
1368 aa  77  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  34.8 
 
 
1628 aa  76.3  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  30.14 
 
 
1028 aa  73.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  34.21 
 
 
2286 aa  72.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.4 
 
 
929 aa  70.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  52.5 
 
 
649 aa  70.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  34.08 
 
 
385 aa  69.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  27.36 
 
 
1581 aa  68.6  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  28.48 
 
 
818 aa  68.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  38.32 
 
 
997 aa  68.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  32.29 
 
 
857 aa  67.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  30.93 
 
 
5743 aa  67.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  47.31 
 
 
608 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  30.7 
 
 
4013 aa  66.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  53.33 
 
 
460 aa  66.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  35.33 
 
 
854 aa  65.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  25.07 
 
 
1471 aa  65.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  32.21 
 
 
1004 aa  65.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  33.01 
 
 
768 aa  65.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  35.75 
 
 
1050 aa  65.1  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  42.86 
 
 
667 aa  65.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  42.55 
 
 
1154 aa  64.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  35.25 
 
 
1070 aa  63.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  34.51 
 
 
571 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.14 
 
 
1321 aa  62.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  29.21 
 
 
464 aa  62.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  44.32 
 
 
552 aa  62.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.22 
 
 
1060 aa  62  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  52.81 
 
 
662 aa  62  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.55 
 
 
756 aa  61.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  44.83 
 
 
997 aa  61.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  38.74 
 
 
648 aa  61.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  30.98 
 
 
879 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  24.36 
 
 
768 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  42.11 
 
 
703 aa  60.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  48.28 
 
 
655 aa  60.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  35.92 
 
 
3802 aa  60.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>