32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7012 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1357    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  77.44 
 
 
671 aa  976    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.51 
 
 
1212 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.63 
 
 
823 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.14 
 
 
1109 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.03 
 
 
1410 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  32.95 
 
 
1091 aa  258  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  31.62 
 
 
1000 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  31.8 
 
 
1213 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.81 
 
 
584 aa  204  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  32.69 
 
 
1200 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.34 
 
 
1448 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  30.56 
 
 
1418 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  28 
 
 
1085 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.78 
 
 
933 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  26.67 
 
 
981 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  30.04 
 
 
431 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.63 
 
 
372 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  25.51 
 
 
419 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  25.51 
 
 
420 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  25.1 
 
 
420 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  25.1 
 
 
421 aa  54.3  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  25.1 
 
 
421 aa  54.3  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  25.1 
 
 
421 aa  54.3  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  25.1 
 
 
420 aa  53.9  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.85 
 
 
372 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  31.58 
 
 
359 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  31.58 
 
 
376 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  30.99 
 
 
364 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  24.59 
 
 
429 aa  47.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.69 
 
 
563 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  23.73 
 
 
423 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>