34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1882 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 1410 aa  2906    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  36.16 
 
 		 1091 aa  325  6e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  32.66 
 
 		 1000 aa  299  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  35.35 
 
 		 1213 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.53 
 
 		 1212 aa  285  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  30.03 
 
 		 675 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.12 
 
 		 823 aa  268  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  29.97 
 
 		 671 aa  264  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.54 
 
 		 584 aa  259  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  32.64 
 
 		 1418 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  29.93 
 
 		 1085 aa  230  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.11 
 
 		 1109 aa  207  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1200 aa  198  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.26 
 
 		 1448 aa  196  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  28.48 
 
 		 981 aa  159  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.81 
 
 		 933 aa  155  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  22.79 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  22.79 
 
 		 424 aa  72  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  22.26 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.91 
 
 		 372 aa  62  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.57 
 
 		 372 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  25.97 
 
 		 431 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  22.38 
 
 		 429 aa  53.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 421 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 420 aa  52.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 420 aa  52.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 421 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 421 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 420 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 419 aa  51.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.1 
 
 		 563 aa  48.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0697  hypothetical protein  31.4 
 
 		 564 aa  46.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000189598  hitchhiker  0.0000524761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  22.45 
 
 		 359 aa  45.8  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  22.45 
 
 		 376 aa  45.8  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>