37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1017 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 
584 aa  1198    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.54 
 
 
1410 aa  259  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  31.31 
 
 
1213 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  30.74 
 
 
671 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  29.81 
 
 
675 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.41 
 
 
823 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.61 
 
 
1091 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  28.96 
 
 
1418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.98 
 
 
1212 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  29.32 
 
 
1000 aa  193  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  28.08 
 
 
1200 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.17 
 
 
1109 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  28.52 
 
 
1085 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.67 
 
 
1448 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.64 
 
 
933 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  25.23 
 
 
981 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.96 
 
 
998 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  41.18 
 
 
622 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.623137 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04825  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 
900 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  25.95 
 
 
419 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  25.95 
 
 
421 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  25.95 
 
 
421 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  25.95 
 
 
421 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  25.95 
 
 
420 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  25.95 
 
 
420 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  25.95 
 
 
420 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  24.82 
 
 
509 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  26.32 
 
 
424 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
1380 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  34.38 
 
 
866 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  40.35 
 
 
1380 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  26.32 
 
 
423 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.88 
 
 
582 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
518 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  25.44 
 
 
424 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.29 
 
 
372 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.29 
 
 
372 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>