19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5633 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  100 
 
 
866 aa  1774    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1761  hypothetical protein  44.77 
 
 
805 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  34.23 
 
 
555 aa  92  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  34.23 
 
 
555 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  34.23 
 
 
555 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  33.33 
 
 
555 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2438  hypothetical protein  34.55 
 
 
840 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  34.39 
 
 
554 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  37.61 
 
 
1065 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4120  hypothetical protein  36.28 
 
 
1371 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.189457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1065  hypothetical protein  29.31 
 
 
775 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0270442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  28.89 
 
 
530 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1884  hypothetical protein  40.54 
 
 
427 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1998  hypothetical protein  33.63 
 
 
497 aa  49.3  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0054926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0655  hypothetical protein  31.03 
 
 
350 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  42.47 
 
 
622 aa  48.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.38 
 
 
584 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  34.68 
 
 
781 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.96 
 
 
582 aa  44.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>