102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0700 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 509 aa  1029    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  49.51 
 
 		 518 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  42.03 
 
 		 447 aa  346  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.88 
 
 		 431 aa  276  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  33.7 
 
 		 541 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  33.08 
 
 		 459 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  31.84 
 
 		 544 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  32.65 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  36.52 
 
 		 542 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  32.56 
 
 		 551 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  36.93 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  32.12 
 
 		 727 aa  223  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 560 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 475 aa  209  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 		 543 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  30.32 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  31.24 
 
 		 463 aa  193  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  30.88 
 
 		 865 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 448 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  32.05 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  30 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  29.85 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  31.01 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.38 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  30.02 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  28.5 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  30 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.1 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 479 aa  143  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  29.12 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  32.47 
 
 		 442 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  32.58 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  26.16 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  32.9 
 
 		 402 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  29.35 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  28.57 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  25.63 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  31.23 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  28.12 
 
 		 543 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  26.76 
 
 		 605 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  29.87 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  36.99 
 
 		 671 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  25.94 
 
 		 602 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  26.26 
 
 		 604 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  24.84 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  27.76 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 		 665 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  26.06 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  28.63 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 		 664 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  34.91 
 
 		 680 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  33.14 
 
 		 665 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  32.56 
 
 		 665 aa  97.8  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  25.78 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  26.64 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 509 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  25.41 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  30.97 
 
 		 488 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  23.18 
 
 		 659 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 606 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  27.45 
 
 		 530 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  25.15 
 
 		 532 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  22.47 
 
 		 659 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  26.51 
 
 		 489 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  27.75 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  27.59 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  24.32 
 
 		 602 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  25 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  25.28 
 
 		 559 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  28.06 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  23.88 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  24.07 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  23.44 
 
 		 544 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  21.57 
 
 		 716 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  21.61 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  21.61 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  25.16 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  29.19 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  27.23 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  26 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  22.6 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  29.59 
 
 		 246 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  26.4 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  27.1 
 
 		 514 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.24 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.82 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  26.29 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  27.17 
 
 		 983 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>