74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1580 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  100 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  42.92 
 
 		 489 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  32.19 
 
 		 492 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  31.82 
 
 		 530 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  31.82 
 
 		 518 aa  98.6  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  29.48 
 
 		 524 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 509 aa  95.5  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  27.31 
 
 		 444 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 		 522 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  29.28 
 
 		 543 aa  82.4  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  29.87 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  30.62 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  31.84 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  24.49 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.13 
 
 		 454 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  33.33 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  29.47 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  27.6 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 460 aa  75.1  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  33.79 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  27.32 
 
 		 416 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  33.54 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  28.12 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  27.6 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  29.86 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  27.57 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  29.48 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  27.01 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  36.52 
 
 		 537 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  30.61 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  28.08 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  39.82 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  27.27 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  31.93 
 
 		 633 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  26.77 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.09 
 
 		 727 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  38.79 
 
 		 605 aa  58.9  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  26.63 
 
 		 470 aa  58.9  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  26.46 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  24.44 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  28.48 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 446 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  31.06 
 
 		 642 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  22.75 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  34.48 
 
 		 602 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 463 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 446 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 		 543 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  29.1 
 
 		 641 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  29.59 
 
 		 509 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  32.52 
 
 		 604 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  25.57 
 
 		 508 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  31.37 
 
 		 532 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 448 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  29.3 
 
 		 649 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.3 
 
 		 478 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 560 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  24.66 
 
 		 669 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  29.2 
 
 		 931 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 518 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.01 
 
 		 442 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  22.53 
 
 		 462 aa  46.2  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 		 548 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  30.77 
 
 		 865 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  27.17 
 
 		 983 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  31.25 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  31.25 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  30.11 
 
 		 503 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  39.53 
 
 		 543 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  24.71 
 
 		 449 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>