42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3754 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  100 
 
 		 983 aa  2017    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 649 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  24.96 
 
 		 537 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 		 548 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  22.35 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  23.16 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  20.93 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  25.14 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  32.76 
 
 		 559 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  19.89 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  22.26 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 606 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  22.78 
 
 		 451 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  20.18 
 
 		 444 aa  57  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  22.31 
 
 		 518 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  43.94 
 
 		 443 aa  55.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 		 544 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  24.4 
 
 		 551 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  20.71 
 
 		 474 aa  53.9  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  24.12 
 
 		 554 aa  54.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  19.59 
 
 		 448 aa  53.5  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 448 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 509 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  22.4 
 
 		 479 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  29.75 
 
 		 470 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  29.57 
 
 		 543 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 462 aa  48.5  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  20.32 
 
 		 444 aa  48.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  37.08 
 
 		 547 aa  48.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  23.01 
 
 		 522 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.22 
 
 		 604 aa  47  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  28.09 
 
 		 605 aa  46.6  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  39.77 
 
 		 460 aa  45.8  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  37.08 
 
 		 467 aa  45.8  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 		 475 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  30.43 
 
 		 530 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  27.17 
 
 		 246 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  27.17 
 
 		 509 aa  45.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  39.77 
 
 		 460 aa  45.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  29.92 
 
 		 641 aa  45.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 446 aa  44.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 446 aa  44.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>