91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0972 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 448 aa  926    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  61.59 
 
 		 444 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  60.68 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  37.06 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  37.35 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  38.07 
 
 		 416 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 479 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 491 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  28.54 
 
 		 542 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  28.73 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  29.75 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  34.43 
 
 		 431 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 509 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  28.76 
 
 		 541 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 522 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  32.14 
 
 		 518 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  27.38 
 
 		 559 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  33.21 
 
 		 530 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  30.14 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  29.05 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  34.75 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  29.24 
 
 		 271 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  32.44 
 
 		 543 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  29.76 
 
 		 524 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  28.57 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  26.6 
 
 		 544 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  28.43 
 
 		 528 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 475 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  24.53 
 
 		 537 aa  113  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  26.99 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  28.11 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  23.86 
 
 		 554 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  29.86 
 
 		 478 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  24.28 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  26.15 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  24.17 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  32.26 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  24.8 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  28.09 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  28.03 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  28.63 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  22.47 
 
 		 727 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  23.25 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 474 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  24.91 
 
 		 865 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  29.17 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  27.17 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  27.17 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  26.26 
 
 		 548 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  25.17 
 
 		 649 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  23.7 
 
 		 543 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  20.7 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 665 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  22.76 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  24.47 
 
 		 604 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 665 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  27.03 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  25.71 
 
 		 671 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  23.4 
 
 		 602 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  22.74 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  22.19 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  27.27 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  30.61 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  22.04 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  23.67 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  19.08 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  24.24 
 
 		 563 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  20.04 
 
 		 983 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  22.16 
 
 		 544 aa  53.5  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  19.59 
 
 		 659 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  25.8 
 
 		 931 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  20.92 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  19.33 
 
 		 659 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  21.53 
 
 		 633 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  21.54 
 
 		 602 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  23.96 
 
 		 669 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  20.32 
 
 		 440 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  22.42 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09134  Rhamnogalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFQ2]  24.73 
 
 		 517 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  20 
 
 		 702 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  20.81 
 
 		 620 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>