97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2888 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 530 aa  1090    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  46.09 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  42.77 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  40.22 
 
 		 489 aa  342  8e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  33.98 
 
 		 524 aa  243  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  29.73 
 
 		 543 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  31.14 
 
 		 518 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  31.81 
 
 		 479 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  34.73 
 
 		 491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  26.94 
 
 		 559 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  27.76 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  30.84 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  31.6 
 
 		 444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  33.21 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  24.9 
 
 		 649 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  32.98 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  32.4 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  31.08 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  28.24 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  30.79 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 475 aa  126  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  30.26 
 
 		 551 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  29.64 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  32.37 
 
 		 460 aa  124  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  30.09 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  27.62 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  32.01 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  23.87 
 
 		 541 aa  120  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  27.7 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  30.34 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  29.39 
 
 		 528 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  26.24 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  28.28 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 560 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  24.49 
 
 		 508 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  28.32 
 
 		 727 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  31.2 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  32.89 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  24.85 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  26.79 
 
 		 554 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  31.82 
 
 		 246 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  26.67 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 446 aa  100  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 446 aa  100  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.11 
 
 		 390 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 442 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  25.97 
 
 		 865 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  25.16 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25 
 
 		 454 aa  97.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  22.92 
 
 		 518 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  29.97 
 
 		 604 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  27.45 
 
 		 509 aa  91.3  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  27.82 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  28.37 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  25.55 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  21.4 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  26.05 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  25.56 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  22.53 
 
 		 665 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 606 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  22.82 
 
 		 665 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  25.08 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  27.91 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.52 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  25.23 
 
 		 680 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  27.83 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  24.73 
 
 		 702 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  24.85 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  23.18 
 
 		 544 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  24.16 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  25.64 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  23.01 
 
 		 931 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  25.08 
 
 		 402 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  22.25 
 
 		 602 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  25.25 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  22.22 
 
 		 518 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  36.84 
 
 		 641 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  29.29 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  23.48 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.44 
 
 		 402 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  30.66 
 
 		 642 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 458 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 458 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  25.66 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 544 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  30.43 
 
 		 983 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 458 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  24.14 
 
 		 531 aa  43.9  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>