108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3030 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  78.9 
 
 		 460 aa  728    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 467 aa  966    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  79.57 
 
 		 460 aa  782    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  79.13 
 
 		 460 aa  779    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  38.38 
 
 		 390 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  35.9 
 
 		 447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  36.9 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  36.93 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  31.92 
 
 		 541 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  33.72 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  30.75 
 
 		 542 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 560 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  29.86 
 
 		 544 aa  180  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  29.45 
 
 		 551 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  28.41 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  32.64 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  37.87 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  32.53 
 
 		 865 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  29.39 
 
 		 508 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  31.3 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  36.21 
 
 		 402 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  28.1 
 
 		 509 aa  143  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  35.97 
 
 		 488 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.35 
 
 		 727 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 543 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  28.81 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  32.98 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  33.44 
 
 		 449 aa  133  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  31.39 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  28.6 
 
 		 528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  29.56 
 
 		 544 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  28.28 
 
 		 451 aa  127  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 446 aa  123  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  35.23 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  29.67 
 
 		 532 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  28.87 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  28.43 
 
 		 602 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 491 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  28.75 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  27.93 
 
 		 443 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  30.95 
 
 		 531 aa  107  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  29.34 
 
 		 605 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 606 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 458 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 458 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  29.53 
 
 		 602 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  28.47 
 
 		 489 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  30.28 
 
 		 543 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.84 
 
 		 604 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  30.37 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  24.07 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  27.85 
 
 		 702 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  28.09 
 
 		 559 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 544 aa  97.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  26.98 
 
 		 544 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.83 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  24.23 
 
 		 659 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  26.91 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  29.17 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  23.8 
 
 		 659 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  25.07 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 716 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  25.14 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  27.6 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  33.33 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  28.04 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 725 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 725 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  26.19 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  24.66 
 
 		 649 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  23.58 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  24.9 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  31.09 
 
 		 271 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  27.73 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  29.12 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  25.46 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  35.54 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 665 aa  57  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  28.96 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 665 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  25.6 
 
 		 680 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  25.12 
 
 		 514 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  24.35 
 
 		 380 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  30.12 
 
 		 633 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  24.36 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  23.53 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 665 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>