99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0498 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  99.1 
 
 		 446 aa  899    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 446 aa  905    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  50.81 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  46.82 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  42.5 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  41.63 
 
 		 865 aa  364  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  40.42 
 
 		 543 aa  316  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  38.88 
 
 		 448 aa  289  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  37.68 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  34.58 
 
 		 544 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  35.1 
 
 		 542 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 		 560 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  33.33 
 
 		 551 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  33.33 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  36.21 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  35.52 
 
 		 665 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 		 665 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 		 665 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  34.67 
 
 		 671 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  33.25 
 
 		 528 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 		 664 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  31 
 
 		 727 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  34.01 
 
 		 541 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  32.49 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.95 
 
 		 431 aa  196  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  32.29 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  33.98 
 
 		 680 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  34.43 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  31.59 
 
 		 509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  30.47 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 		 518 aa  156  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  28.47 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  25.84 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  27.52 
 
 		 508 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  29.49 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  30 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  29.38 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  29.38 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  25.98 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  26.54 
 
 		 602 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  27.25 
 
 		 524 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  25.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.45 
 
 		 543 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  26.69 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  29.08 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  23.64 
 
 		 605 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  23.64 
 
 		 604 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  29.01 
 
 		 530 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  27.85 
 
 		 454 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  29.83 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  25.42 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.28 
 
 		 442 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  25.72 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  25.91 
 
 		 559 aa  96.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 606 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 		 489 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  24 
 
 		 444 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  22.25 
 
 		 659 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  22.25 
 
 		 659 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  24.53 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  28.16 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  26.56 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  23.36 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  25.2 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  24.54 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  22.26 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  21.51 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  22.99 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  29.37 
 
 		 931 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  30 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  22.78 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  32.46 
 
 		 669 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  29.17 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  22.81 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  28.16 
 
 		 246 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  27.74 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  31.67 
 
 		 642 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  24.9 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  28.86 
 
 		 531 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  22.13 
 
 		 620 aa  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  19.65 
 
 		 649 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 716 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  25.44 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 		 725 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 		 725 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.55 
 
 		 582 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  30.77 
 
 		 983 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  20.91 
 
 		 543 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>