78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0125 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  100 
 
 
633 aa  1291    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  47.26 
 
 
641 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  45.5 
 
 
642 aa  511  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  36.28 
 
 
669 aa  313  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  31.86 
 
 
931 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  27.62 
 
 
447 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  38.52 
 
 
524 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  27.06 
 
 
559 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  29.45 
 
 
246 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.03 
 
 
543 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  23.13 
 
 
444 aa  63.9  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  35.71 
 
 
1392 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  33.09 
 
 
470 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  27.24 
 
 
530 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  33.07 
 
 
1405 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 
448 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  25.85 
 
 
443 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  26.07 
 
 
492 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
446 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 
509 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  32.06 
 
 
755 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 
491 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  29.66 
 
 
446 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 
560 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  24.8 
 
 
455 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  30.5 
 
 
542 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  30.82 
 
 
518 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 
522 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  31.82 
 
 
865 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  33.33 
 
 
544 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  36.13 
 
 
373 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
460 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  25.32 
 
 
390 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  29.06 
 
 
554 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  30.12 
 
 
467 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  23.98 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  33.93 
 
 
551 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 
475 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 
518 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
474 aa  55.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
606 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  29.7 
 
 
312 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  26.18 
 
 
649 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  31.62 
 
 
528 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  34.4 
 
 
659 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  29.43 
 
 
460 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  30.51 
 
 
495 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  26.7 
 
 
459 aa  51.6  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  34.82 
 
 
541 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  43.59 
 
 
702 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  30.77 
 
 
460 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  26.32 
 
 
659 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  28.12 
 
 
723 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  32.73 
 
 
1049 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  24.75 
 
 
431 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  26.4 
 
 
665 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  41.94 
 
 
1121 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  21.53 
 
 
448 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
442 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  32.39 
 
 
537 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  35.23 
 
 
1413 aa  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 
463 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  34.29 
 
 
727 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 
665 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 
664 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  42.37 
 
 
503 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  24.82 
 
 
489 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  26.47 
 
 
496 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  30.59 
 
 
649 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  27.35 
 
 
454 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  33.9 
 
 
478 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  33.33 
 
 
605 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 
665 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  25.2 
 
 
372 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  31.73 
 
 
454 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  31.78 
 
 
509 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1699  hypothetical protein  25.09 
 
 
489 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.72795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>