97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4115 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 560 aa  1139    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  46.96 
 
 		 544 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  46.22 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  48.04 
 
 		 551 aa  495  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  46.53 
 
 		 727 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  42.77 
 
 		 474 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  35.85 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  37.81 
 
 		 508 aa  297  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  35.58 
 
 		 522 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  35.86 
 
 		 542 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  35.1 
 
 		 447 aa  267  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  32.87 
 
 		 528 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  33.47 
 
 		 543 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  32.98 
 
 		 865 aa  249  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 		 446 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  32.13 
 
 		 521 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  32.24 
 
 		 470 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  30.39 
 
 		 541 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  31.74 
 
 		 475 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  33.58 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  31.86 
 
 		 431 aa  225  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  30.17 
 
 		 509 aa  209  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  29.3 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 518 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 448 aa  193  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  31.6 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 460 aa  183  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  29.03 
 
 		 467 aa  179  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  28.87 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  30.11 
 
 		 460 aa  177  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  29.52 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  29.14 
 
 		 671 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 665 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 665 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 		 664 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  25.96 
 
 		 451 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.55 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  27.41 
 
 		 680 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  28.54 
 
 		 604 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  27.86 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  26.46 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 491 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  27.25 
 
 		 602 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  26.85 
 
 		 443 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  29.76 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  25.98 
 
 		 605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 606 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 479 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  26.98 
 
 		 489 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  28.44 
 
 		 530 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  25.52 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  25.21 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  23.09 
 
 		 659 aa  100  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  23.25 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  21.88 
 
 		 659 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  24.23 
 
 		 702 aa  96.3  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 548 aa  94  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  23.75 
 
 		 442 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  24.92 
 
 		 454 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  22.05 
 
 		 444 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  23.97 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.73 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  25.08 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  22.16 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  25.74 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  23.94 
 
 		 559 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  26.18 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  23.52 
 
 		 725 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  23.52 
 
 		 725 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 		 716 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  33.99 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  24.21 
 
 		 402 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.84 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  33.33 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  23.93 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  25.58 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  23.83 
 
 		 602 aa  63.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  26.58 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  21.97 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  34.21 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  33.91 
 
 		 641 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  37.84 
 
 		 547 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  23.67 
 
 		 271 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  22.8 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  22.16 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  22.16 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  26.24 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  32.46 
 
 		 642 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02590  polygalacturonase, putative  28.14 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  22.66 
 
 		 620 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  29.66 
 
 		 649 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>