34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02590 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC02590  polygalacturonase, putative  100 
 
 		 478 aa  996    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  31.79 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  29.37 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09045  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARN5]  30.65 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787834  normal  0.693442 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  27.16 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.59 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  27.44 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11626  hypothetical protein  35.96 
 
 		 98 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  23.39 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  26.54 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  24.78 
 
 		 431 aa  57  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  22.45 
 
 		 380 aa  57  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  24.13 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  24.77 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  25.87 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  25.55 
 
 		 460 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 		 560 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  23.02 
 
 		 361 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  24.86 
 
 		 402 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  22.3 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 865 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  23.45 
 
 		 543 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.59 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  21.63 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  22.02 
 
 		 522 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  23.32 
 
 		 521 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  26.67 
 
 		 563 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  26.98 
 
 		 455 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>