75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3277 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 458 aa  906    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  99.34 
 
 		 458 aa  900    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 458 aa  906    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  27.79 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  28.02 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.93 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.39 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.93 
 
 		 437 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.89 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  28.85 
 
 		 541 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  30.03 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  30.91 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.33 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  27.65 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  32.54 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  26.61 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  26.37 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  25.19 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  24.87 
 
 		 865 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  24.87 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  24.08 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  29.33 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  27.78 
 
 		 542 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  26.79 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  28.48 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  22.86 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  31.94 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  24.8 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  26.42 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  23.64 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  27.27 
 
 		 602 aa  60.1  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  34.15 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  23.23 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  22.43 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  29.32 
 
 		 514 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  22.14 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  22.67 
 
 		 659 aa  57  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  23 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  25.09 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  23.84 
 
 		 524 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 716 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09045  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARN5]  24.66 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787834  normal  0.693442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  22.94 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  26.16 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  24.73 
 
 		 604 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  25.13 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.42 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  22.74 
 
 		 530 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  22.32 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02590  polygalacturonase, putative  24.61 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  23.33 
 
 		 602 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  21.45 
 
 		 543 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  28 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  23.55 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  21.91 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  26.21 
 
 		 563 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  22.8 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  23.39 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  24.57 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>