103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4285 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 543 aa  1101    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  39.7 
 
 		 475 aa  350  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  43.95 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  41.78 
 
 		 865 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  40.65 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  40.42 
 
 		 446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  35.67 
 
 		 542 aa  323  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  41.33 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 522 aa  317  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  39.81 
 
 		 455 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  39.53 
 
 		 528 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  34.92 
 
 		 551 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  33.33 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  34.31 
 
 		 544 aa  292  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  34.9 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  35.89 
 
 		 447 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  33.47 
 
 		 560 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  35.22 
 
 		 448 aa  259  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 		 474 aa  259  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  33.04 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  32.84 
 
 		 727 aa  249  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  31.84 
 
 		 541 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  34.48 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  34.49 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  37.74 
 
 		 459 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  35.71 
 
 		 478 aa  203  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  29.98 
 
 		 671 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.21 
 
 		 390 aa  190  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 664 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 665 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 665 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  27.79 
 
 		 665 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  30.77 
 
 		 680 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  30.87 
 
 		 508 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  29.59 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  28.73 
 
 		 460 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  28.67 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.95 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  27.82 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 491 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  24.51 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  28.93 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  26.41 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  28.34 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  29.35 
 
 		 444 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  25.13 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  31.12 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  30.61 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  28.72 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  24.04 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  25.66 
 
 		 602 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  26.54 
 
 		 604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  26.46 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 479 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  30.83 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  27.97 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  28.48 
 
 		 530 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  24.94 
 
 		 605 aa  109  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 548 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  24.24 
 
 		 659 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  23.59 
 
 		 659 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  25.88 
 
 		 442 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  27.19 
 
 		 489 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  24.15 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  25.66 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  24.86 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  25.33 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  23.75 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  24.92 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  27.18 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  28.03 
 
 		 641 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  22.06 
 
 		 543 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  28.24 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  30.54 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  24.59 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  30 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  23.14 
 
 		 602 aa  60.1  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  36.7 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  21.49 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  29.66 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 		 458 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  31.4 
 
 		 620 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  21.37 
 
 		 514 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  25.45 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  23.67 
 
 		 633 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  27 
 
 		 931 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  22.44 
 
 		 440 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  34.23 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  35.29 
 
 		 983 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  22.06 
 
 		 434 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09045  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARN5]  20.18 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787834  normal  0.693442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>