98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2457 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 
508 aa  1029    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  37.34 
 
 
544 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  39.82 
 
 
554 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  37.81 
 
 
560 aa  309  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  37.63 
 
 
551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  39.64 
 
 
727 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  35.22 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  34.45 
 
 
462 aa  261  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  33.26 
 
 
542 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  32.91 
 
 
522 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  31.72 
 
 
541 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.71 
 
 
447 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  33.74 
 
 
459 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  28.76 
 
 
865 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  31.84 
 
 
431 aa  170  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  29.49 
 
 
528 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  29.78 
 
 
478 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  30.87 
 
 
543 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 
463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 
475 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  29.45 
 
 
467 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  29.88 
 
 
521 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  29.62 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  26.56 
 
 
509 aa  147  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  27.59 
 
 
460 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  29.18 
 
 
455 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  27.59 
 
 
460 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  28.38 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 
446 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 
446 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  27.27 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  30.1 
 
 
602 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  28.78 
 
 
605 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  30.03 
 
 
604 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  25.43 
 
 
530 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  25.87 
 
 
671 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 
665 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  24.34 
 
 
443 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
509 aa  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 
665 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
665 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  26.33 
 
 
449 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
664 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  23.81 
 
 
451 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 
606 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  26.84 
 
 
524 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  24.48 
 
 
492 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  25.62 
 
 
659 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  27.03 
 
 
659 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  26.99 
 
 
680 aa  97.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  23.19 
 
 
702 aa  97.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  25.22 
 
 
559 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  23.13 
 
 
518 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  28.28 
 
 
442 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  24.16 
 
 
489 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  23.1 
 
 
444 aa  89  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  22.45 
 
 
543 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 
725 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 
725 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  23.18 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  25.22 
 
 
532 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  24.82 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  26.2 
 
 
602 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  24.5 
 
 
454 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.45 
 
 
402 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.78 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  23.05 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  26.23 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 
716 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  33.33 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  24.14 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  25 
 
 
537 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  24.38 
 
 
544 aa  71.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.44 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  29.86 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 
548 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  25.57 
 
 
246 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 
544 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 
458 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
458 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
458 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  23.12 
 
 
544 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  24.47 
 
 
543 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  23.62 
 
 
380 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  32.77 
 
 
649 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  24.29 
 
 
620 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  30.34 
 
 
642 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  22.16 
 
 
271 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  45.45 
 
 
582 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  23.32 
 
 
514 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  21.76 
 
 
361 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  38.33 
 
 
503 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>